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Enregistrement W6940076015 · doi:10.6084/m9.figshare.c.6610400

Data source profile reporting by studies that use routinely collected health data to explore the effects of drug treatment

2024· other· en· W6940076015 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typeother
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésData sourceCredibilityObservational studyMEDLINERecord linkageMedical recordUnder-reportingPublicationAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Routinely collected health data (RCD) are important resource for exploring drug treatment effects. Adequate reporting of data source profiles may increase the credibility of evidence generated from these data. This study conducted a systematic literature review to evaluate the reporting characteristics of databases used by RCD studies to explore the effects of drug treatment. Methods Observational studies published in 2018 that used RCD to explore the effects of drug treatment were identified by searching PubMed. We categorized eligible reports into two groups by journal impact factor (IF), including the top 5 general medical journals (NEJM, Lancet, JAMA, BMJ and JAMA Internal Medicine) and the other journals. The reporting characteristics of the databases used were described and compared between the two groups and between studies citing and not citing database references. Results A total of 222 studies were included, of which 53 (23.9%) reported that they applied data linkage, 202 (91.0%) reported the type of database, and 211 (95.0%) reported the coverage of the data source. Only 81 (36.5%) studies reported the timeframe of the database. Studies in high-impact journals were more likely to report that they applied data linkage (65.1% vs. 20.2%) and used electronic medical records (EMR) (73.7% vs. 30.0%) and national data sources (77.8% vs. 51.3%) than those published in other medical journals. There were 137/222 (61.7%) cited database references. Studies with database-specific citations had better reporting of the data sources and were more likely to publish in high-impact journals than those without (mean IF, 6.08 vs. 4.09). Conclusions Some deficits were found in the reporting quality of databases in studies that used RCD to explore the effects of drug treatment. Studies citing database-specific references may provide detailed information regarding data source characteristics. The adoption of reporting guidelines and education on their use is urgently needed to promote transparency by research groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,245
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,693
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,755
Score d'incertitude au seuil0,931

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2450,693
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,009
Bibliométrie0,0330,041
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0070,008
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,321
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,036 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomainePrésentation des résultats
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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