Molecular Cloning and Expression Analysis of Endogenous Cellulase EsGH9-1 from Eriocheir sinensis and Its Response to Different Diets
Notice bibliographique
Résumé
Cellulases are a class of modular enzymes with a catalytic glycoside hydrolase (GH) module that hydrolyzes the β-1, 4-glucosidic bond of the cellulose chain. Cellulases had been broadly divided into three types: endo-β-1, 4-glucanases, exo-β-1, 4-glucanases and β-glucosidases, which of synergistic effect lead to the complete degradation of cellulose to glucose. The endo-β-1, 4-glucanase is one of the key cellulases in cellulose digestion, which are likely to be the product of a glycosyl hydrolase family 9 (GHF9) gene. In this study, an endogenous cellulase gene, EsGH9-1, was identified from the transcriptome database of the Chinese mitten crab, Eriocheir sinensis, and the sequence of EsGH9-1 was cloned by PCR. The expression levels of EsGH9-1 in different tissues and different developmental stages were studied. In addition, EsGH9-1 mRNA expression and corresponding enzyme activity under different diet conditions were analysed. The result showed that EsGH9-1 genomic DNA (11 679 bp) consists of 15 exons interrupted by 14 introns; EsGH9-1 cDNA (2044 bp) contains an open reading frame of 1740 bp, corresponding to a polypeptide of 580 amino acid residues, with a typical catalytic domain of the glycosyl hydrolase family 9 (GHF9). EsGH9-1 was expressed in various tissues of E. sinensis, particularly high in the hepatopancreas. A significant increase in expression of EsGH9-1 was also observed in megalopa and early-stage larvae. Under different dietary conditions, the relative expression of EsGH9-1 in the plant diet group was significantly up-regulated, which was consistent with the trend of β-1, 4-endoglucanase activity. The finding of the endogenous cellulase gene (EsGH9-1) in E. sinensis implies that EsGH9-1 may be involved in the decomposition of plant diet. Furthermore, this work is a fundamental step toward understanding the role of endogenous cellulase in the digestion mechanism of aquatic crustaceans.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
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