Characterization of 2 <i>Klebsiella pneumoniae</i> carbapenemase–producing Enterobacterales isolated from canine rectal swabs
Notice bibliographique
Résumé
Globally, carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) cause life-threatening, hospital-acquired infections in people, and have been reported recently among veterinary patients. Organisms that produce a <i>Klebsiella pneumoniae</i> carbapenemase (KPC) are one of the most common CPE isolated from people but have been reported only rarely in animals. We characterized 2 KPC-producing Enterobacterales isolated from companion animal rectal swabs during the response to an outbreak caused by a strain of <i>bla</i><sub>NDM-5</sub> <i>Escherichia coli</i>. Both isolates were characterized by whole-genome sequencing (WGS) and analysis. The first isolate (case A) was from an immunosuppressed 6-y-old Yorkshire Terrier and was identified as <i>E. coli</i> (ST372) with a <i>bla</i><sub>KPC-18</sub> gene and an IncFII plasmid. The second isolate (case B) was from a 3-y-old Labrador Retriever with acute diarrhea and was identified as <i>Citrobacter koseri</i> with a <i>bla</i><sub>KPC-2</sub> gene, multiple plasmids (ColRNAI, pKPC-CAV1193), and a putative enterotoxin gene (<i>senB</i>). Further research is needed to determine what role animals might play in the epidemiology of CPE in communities. It is imperative that all CPE isolated from companion animals be fully characterized by WGS and the associated case examined. All veterinary isolates should be sequenced and shared for surveillance, monitoring, and investigation purposes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».