Integrated environmental and clinical surveillance for the prevention of acute respiratory infections in closed settings and vulnerable communities: school, prison and nursing home (Stell-ARI Project)
Notice bibliographique
Résumé
Theme: Importance of a global wastewater surveillance system for public health Background: Water borne pollutants are a known link to increasing levels of antimicrobial resistance (AMR). An important route for AMR into the environment is via sewerage networks where potential key control points are located in wastewater treatment plants (WWTPs) ¹. Presently there is no mainstream strategy to influence the emerging persistent antibiotic and heavy metal contamination linking resistance gene contamination in wastewater (WW) and WWTP biofilms. Methods: Qualitative and quantitative analysis of WW and WWTP biofilms from four different sampling points (in triplicate) throughout the WWTP over a yearlong sampling campaign. Flame Atomic Absorption Spectrophotometry (FAAS) for heavy metal (HM) quantification (Cr, Cu, Fe, Pb, Mg, Mn, Ni, Ag and Zn). High-Pressure Liquid Chromatography Mass Spectrometry/MS (HPLC-MS/MS) for antibiotic detection and quantification (amoxicillin, azithromycin, ciprofloxacin, clarithromycin, erythromycin, flucloxacillin, metronidazole, ofloxacin, sulfamethoxazole and trimethoprim). High-Throughput real-time chip PCR (qPCR) for quantification of AMR genes (qepA, sul1_2, blandM, blaCTX-M, blaTEM_1, tetX, mcr1, nimE, ermF_1, acc(6’)-Ib_2 and dfrA1_1). Results: A detection was made of significant seasonal variations of pharmaceuticals and heavy metals in conjunction with the identification of associated AMR genes in wastewater and biofilms. Several of the antibiotics were detected over the predicted no-effect concentration (PNEC)² in both the wastewater and in the biofilms with one producing a bio-concentration factor of 3.1, which classifies it (according to EU guidelines) as bio-accumulative in the WWTP. This accumulation may be significantly influencing which resistance genes transfer into the receiving environmental waters. Conclusion and Future Work: The bioaccumulation of heavy metals and antibiotics by wastewater biofilms may influence the quantity of resistance genes found in the surrounding aquatic environment. This research will guide wastewater management to reduce AMR. It will also provide concentrations for the next stage of this study into the phycoremediation of antibiotics and heavy metals using the micro-algae Chlamydomonas acidophila. A photo-bioreactor culturing these algae in WW may reduce the bioavailability of antibiotics and heavy metals throughout the WWTP and reduce AMR in the environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,012 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».