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Enregistrement W6947892149 · doi:10.48336/q6ga-ht87

Understanding the molecular mechanisms of arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy caused by TMEM43 p.S358L mutation

2023· article· en· W6947892149 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiological and pharmacological studies of plants
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationEndosomeCardiomyopathyInduced pluripotent stem cellPopulationIntracellularOrganelleTransmembrane proteinGeneDilated cardiomyopathy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) is a genetic cardiac disease characterized by fibrofatty infiltration of the myocardium, life-threatening arrhythmias, and sudden cardiac death. Newfoundland and Labrador is home to a substantial founder population with an autosomal dominant mutation in the transmembrane protein 43 (TMEM43) gene (c.1073C>T; p.S358L), responsible for ARVC type 5. Although we know that this mutation causes ARVC, there is limited information on the TMEM43 protein life cycle, protein-protein interactions, and function. Additionally, it is unknown how the p.S358L mutation affects TMEM43 function, contributes to ARVC, or why it affects only the heart despite being widely expressed. Here I investigate the intracellular trafficking of wild-type TMEM43 in human induced pluripotent stem cells (iPSCs) and iPSC-cardiomyocytes (iPSC-CMs). I find that TMEM43 resides primarily in early endosomes in iPSCs. Interestingly, although TMEM43 remains localized to early endosomes in early contracting iPSC-CMs, it shifts toward the nuclear envelope as iPSC-CMs are cultured in vitro for an extended period of time. CRISPR-Cas9 genetic ablation of the TMEM43 gene has no apparent effects on several intracellular organelles previously shown to be affected by the TMEM43-S358L mutation. However, TMEM43-/- iPSC-CMs exhibit subtle calcium handling aberrations pointing toward a pro-arrhythmic phenotype. Finally, primary ARVC patient dermal fibroblasts show significant changes in the expression of extracellular matrix proteins, which may play a role in the fibrosis seen in ARVC. Together, these studies begin to unravel the basic life cycle and function of the TMEM43 protein in a human-derived cellular model of ARVC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,293
Score d'incertitude au seuil0,946

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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