MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6947892149 · doi:10.48336/q6ga-ht87

Understanding the molecular mechanisms of arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy caused by TMEM43 p.S358L mutation

2023· article· en· W6947892149 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiological and pharmacological studies of plants
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationEndosomeCardiomyopathyInduced pluripotent stem cellPopulationIntracellularOrganelleTransmembrane proteinGeneDilated cardiomyopathy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) is a genetic cardiac disease characterized by fibrofatty infiltration of the myocardium, life-threatening arrhythmias, and sudden cardiac death. Newfoundland and Labrador is home to a substantial founder population with an autosomal dominant mutation in the transmembrane protein 43 (TMEM43) gene (c.1073C>T; p.S358L), responsible for ARVC type 5. Although we know that this mutation causes ARVC, there is limited information on the TMEM43 protein life cycle, protein-protein interactions, and function. Additionally, it is unknown how the p.S358L mutation affects TMEM43 function, contributes to ARVC, or why it affects only the heart despite being widely expressed. Here I investigate the intracellular trafficking of wild-type TMEM43 in human induced pluripotent stem cells (iPSCs) and iPSC-cardiomyocytes (iPSC-CMs). I find that TMEM43 resides primarily in early endosomes in iPSCs. Interestingly, although TMEM43 remains localized to early endosomes in early contracting iPSC-CMs, it shifts toward the nuclear envelope as iPSC-CMs are cultured in vitro for an extended period of time. CRISPR-Cas9 genetic ablation of the TMEM43 gene has no apparent effects on several intracellular organelles previously shown to be affected by the TMEM43-S358L mutation. However, TMEM43-/- iPSC-CMs exhibit subtle calcium handling aberrations pointing toward a pro-arrhythmic phenotype. Finally, primary ARVC patient dermal fibroblasts show significant changes in the expression of extracellular matrix proteins, which may play a role in the fibrosis seen in ARVC. Together, these studies begin to unravel the basic life cycle and function of the TMEM43 protein in a human-derived cellular model of ARVC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMemorial University Research Repository (Memorial University)Même sujetBiological and pharmacological studies of plantsTravaux en français237 207