Regulation of interferon regulatory factor 1[IRF1] antiviral functions by its ubiquitination
Notice bibliographique
Résumé
Interferon regulatory factor 1 (IRF1) is a transcriptional factor that regulates the expression of antiviral genes. IRF1 expression is downregulated in cancer cells, which supports efficient replication of oncolytic viruses. Posttranslational modifications are one of the major cellular mechanisms that regulate IRF1 expression and functions. To understand roles of IRF1 ubiquitination on innate antiviral immunity, we determined the antiviral activity of IRF1 ubiquitin resistant mutants. IRF1 ubiquitin resistant mutants (78K, 275K, and 299K) were generated and transfected into DLD-1, DU145 or MDA-MB-468 cells. The cells were then challenged with vesicular stomatitis virus (VSV) at MOI 1. Virus infection was evaluated by Western blotting against vesicular stomatitis virus glycoprotein (VSV-G), and progeny virus production. The 275K or 299K mutants showed higher antiviral activity when compared to wild type IRF1. Conversely, cells transfected with the 78K mutant were more susceptible to VSV infection than those transfected with wild type IRF1. In conclusion, 78K, 275K, and 299K sites are IRF1 ubiquitination sites which regulate IRF1 antiviral functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».