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Enregistrement W6948043036 · doi:10.48336/d4hb-xw58

An association study exploring the genetic relationship of psoriatic arthritis and obesity

2022· article· en· W6948043036 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueSubterranean biodiversity and taxonomy
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeObesitySingle-nucleotide polymorphismSNPPsoriatic arthritisGenetic associationAlleleBody mass index

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: To determine if there is a genetic component causing psoriatic arthritis (PsA) patients to have higher BMIs when compared to the general population. Method: 696 obese samples were identified from a previous genetic study on obesity which were genotyped using a PsA SNP panel. 650 PsA patients who were examined for PsA related anthropometric measures were genotyped using an obesity SNP panel. An obesity panel was created using a gene prioritization method to create a 46 SNP obesity-weighted panel. Two separate quantitative trait analyses were performed to obtain the association between BMI and genotype of the subsequent panels using a linear regression model. Bonferroni correction was used to adjust for multiple comparisons. Results: Genotypes of two PsA-weighted SNPs, rs10782001 (FBXL19) and rs3131382 (HLA-B*39), showed a significant difference with BMI. Patients with the FBXL19 variant had an average BMI in the presence of GG genotype of 37.2 kg/m² vs 34.3 kg/m² for the AA genotype (p=0.0007). Patients with the HLA-B*39:05 variant had an average BMI with the TT genotype of 47.1 kg/m2 vs 35.4 kg/m² for the CC genotype (p=0.00005). One obesity-weighted SNP, rs11915371 (SAMMSON/FOXP1), showed a significant difference of BMI between genotypes in PsA patients. The average BMI of those with the CC genotype was 32.42 kg/m² compared to an average BMI of 29.77 kg/m² with the TT genotype (p=0.0009). Conclusion: Homozygotes for the minor allele of SNPs within HLA-B*39, FBXL19, and SAMMSON/FOXP1 have shown to have an increased BMI, suggesting a potential genetic link between these genes and PsA and obesity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0040,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,147 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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