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Enregistrement W6948216531 · doi:10.5061/dryad.ns1rn8ppd

Cancer cells optimize elasticity for efficient migration

2020· dataset· en· W6948216531 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueResearch Data Management Practices
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer cellCell migrationStiffnessElasticity (physics)CellCytoskeletonCell mechanicsCancerCell typeStrain (injury)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer progression is associated with alternations in the cytoskeletal architecture of cells and, consequently, their mechanical properties such as stiffness. Changing the mechanics of cells enables cancer cells to migrate and invade to distant organ sites. This process, metastasis, is the main reason for cancer-related mortality. Cell migration is an essential step toward increasing the invasive potential of cells. Although many studies have shown that the migratory speed and the invasion of cells can be inversely correlated to the stiffness of cells, some other investigations indicate exactly opposing results. In the current work, based on the strain energy stored in cells due to the contractile forces, we defined an energy-dependent term, migratory index, to approximate how changes in the mechanical properties of cells influence cell migration required for cancer progression. Cell migration involves both cell deformation and force transmission within cells. The effects of these two parameters can be represented equally by the migratory index. Our mechanical modeling and computational study show that cells depending on their shape, size, and other physical parameters, have a maximum migratory index taking place at a specific range of cell bulk stiffness, indicating the most favorable conditions for invasive mobility. This approximate model can be used to explain why the stiffness of cells varies during cancer progression. We believe that the stiffness of invasive cells depending on the stiffness of their non-invasive counterparts is either decreased or increased to reach the critical condition in which the mobility potential of cells is approximated to be maximum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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