The origins of asexual brine shrimps
Notice bibliographique
Résumé
Determining how and how often asexual lineages emerge within sexual species is central to our understanding of sex-asex transitions and the long-term maintenance of sex. Asexuality can arise “by transmission” from an existing asexual lineage to a new one, through different types of crosses. The occurrence of these crosses, cryptic sex, variation in ploidy and recombination within asexuals greatly complicates the study of sex-asex transitions, as they preclude the use of standard phylogenetic methods and genetic distance metrics. In this study we show how to overcome these challenges by developing new approaches to investigate the origin of the various asexual lineages of the brine shrimp Artemia parthenogenetica. We use a large sample of asexuals, including all known polyploids, and their sexual relatives. We combine flow cytometry with mitochondrial and nuclear DNA data. We develop new genetic distance measures and methods to compare various scenarios describing the origin of the different lineages. We find that all diploid and polyploid A. parthenogenetica likely arose within the last 80,000 years through successive and nested hybridization events that involved backcrosses with different sexual species. All A. parthenogenetica have the same common ancestor and therefore likely carry the same asexuality gene(s) and reproduce by automixis. These findings radically change our view of sex-asex transitions in this group, and show the importance of considering asexuality “by transmission” scenarios. The methods developed are applicable to many other asexual taxa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,025 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».