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Enregistrement W6948331910 · doi:10.5061/dryad.56b1t40

Data from: Opsin genes of select treeshrews resolve ancestral character states within Scandentia

2019· dataset· en· W6948331910 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueData Archiving and Networked Services (DANS) · 2019
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueForest Ecology and Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOpsinGeneSelection (genetic algorithm)Genetic algorithmTraitCharacter (mathematics)RhodopsinSynonym (taxonomy)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Treeshrews are small, squirrel-like mammals in the order Scandentia, which is nested together with Primates and Dermoptera in the superordinal group Euarchonta. They are often described as living fossils, and researchers have long turned to treeshrews as a model or ecological analogue for ancestral primates. A comparative study of colour vision-encoding genes within Scandentia found a derived amino acid substitution in the long-wavelength sensitive opsin gene (OPN1LW) of the Bornean smooth-tailed treeshrew (Dendrogale melanura). The opsin, by inference, is red-shifted by ca. 6 nm with an inferred peak sensitivity of 561 nm. It is tempting to view this trait as a novel visual adaptation; however, the genetic and functional diversity of visual pigments in treeshrews is unresolved outside of Borneo. Here we report gene sequences from the northern smooth-tailed treeshrew (Dendrogale murina) and the Mindanao treeshrew (Tupaia everetti, the senior synonym of Urogale everetti). We found that the opsin genes are under purifying selection and that D. murina shares the same substitution as its congener, a result that distinguishes Dendrogale from other treeshrews, including T. everetti. We discuss the implications of opsin functional variation in light of limited knowledge about the visual ecology of smooth-tailed treeshrews.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,319
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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