Data from: Opsin genes of select treeshrews resolve ancestral character states within Scandentia
Notice bibliographique
Résumé
Treeshrews are small, squirrel-like mammals in the order Scandentia, which is nested together with Primates and Dermoptera in the superordinal group Euarchonta. They are often described as living fossils, and researchers have long turned to treeshrews as a model or ecological analogue for ancestral primates. A comparative study of colour vision-encoding genes within Scandentia found a derived amino acid substitution in the long-wavelength sensitive opsin gene (OPN1LW) of the Bornean smooth-tailed treeshrew (Dendrogale melanura). The opsin, by inference, is red-shifted by ca. 6 nm with an inferred peak sensitivity of 561 nm. It is tempting to view this trait as a novel visual adaptation; however, the genetic and functional diversity of visual pigments in treeshrews is unresolved outside of Borneo. Here we report gene sequences from the northern smooth-tailed treeshrew (Dendrogale murina) and the Mindanao treeshrew (Tupaia everetti, the senior synonym of Urogale everetti). We found that the opsin genes are under purifying selection and that D. murina shares the same substitution as its congener, a result that distinguishes Dendrogale from other treeshrews, including T. everetti. We discuss the implications of opsin functional variation in light of limited knowledge about the visual ecology of smooth-tailed treeshrews.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».