Supplement to Projected future climatic forcing on the global distribution of vegetation types
Notice bibliographique
Résumé
This repository contains the supplementary files for: Allen BJ, Hill DJ, Burke AM, Clark M, Marchant R, Stringer LC, Williams DR, Lyon C. 2024. Projected future climatic forcing on the global distribution of vegetation types. Philosophical Transactions of the Royal Society B. Description of files This repository contains the BIOME4 output files, the R code used to analyse them, and a selection of data tables summarising the results. netCDFs.zip - The raw BIOME4 outputs cleaned.zip - The cleaned biome datasets, as .csv files, describing the biome attributed to each cell in each time slice, for biomes and megabiomes, and with different human footprints (from the HYDE dataset) removed ranges.zip - Summary tables describing the latitudinal ranges, in each hemisphere, of each biome for each time slice centroids.zip - Summary tables describing the shift of each biome's centroid, in each hemisphere, between time slices counts.zip - Summary tables describing the number of grid cells not adjacent to their attributed biome in the previous time slice biome_conversion.txt - The table for converting between biome and megabiome attribution R_code.zip - All R code used to conduct analyses Description of R code The R code is subdivided into the following files: Read_nc.R - Code to read in netCDF files (containing BIOME4 outputs), clean, add area of cells, and convert to .csv Read_footprint.R - Code to cut the HYDE anthrome footprints out of the BIOME4 outputs Matrix_comparison.R - Code calculating the proportion of area changing biomes over time (creates Figure 2a & 3a) Biome_overlap.R - Code calculating the overlap of area attributed to each biome over time (creates Figure 2b & 3b) Unoccupiable_cells.R - Code calculating the proportion of cells attributed to a biome which are not adjacent to that same biome in the previous time slice (creates Figure S5) Biome_share.R - Code showing the change in total area for each biome over time (creates Figure S6 & S7) Centroid_shift.R - Code calculating the latitudinal ranges and centroids for each biome over time (creates Figure S8) Patchiness.R - Code calculating the number of patches of each biome over time (creates Figure S9)
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,425 | 0,266 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».