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Enregistrement W6950266592 · doi:10.5281/zenodo.7516526

nipy/nibabel: 5.0.0

2023· other· en· W6950266592 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2023
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenMcGill UniversitySickKids FoundationMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de SherbrookeBaycrest HospitalUbisoft (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCode (set theory)HeaderFeature (linguistics)Test (biology)InitializationClass (philosophy)Field (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

New feature release in the 5.0.x series. Most work on NiBabel so far has been by Matthew Brett (MB), Chris Markiewicz (CM), Michael Hanke (MH), Marc-Alexandre Côté (MC), Ben Cipollini (BC), Paul McCarthy (PM), Chris Cheng (CC), Yaroslav Halchenko (YOH), Satra Ghosh (SG), Eric Larson (EL), Demian Wassermann, Stephan Gerhard and Ross Markello (RM). New features SerializableImage now has to_stream() and from_stream() methods to read/write streams implementing the io.IOBase interface. A from_url() method enables loading images from URLs. (pr/1129) (CM, reviewed by MB) TrkFile supports TRKv3, an undocumented but generally compatible variant of TRKv2. (pr/1125) (CM) Enhancements Support multiline header fields in TCKFile (pr/1175) (CM, reviewed by Matt Cieslak) Make layout order an initialization parameter of ArrayProxy (pr/1131) (CM, reviewed by MB) Initial support for type annotations. (pr/1115, pr/1178) (CM, reviewed by Zvi Baratz) Bug fixes Handle extension/file-format mismatches implemented incompletely in pr/1013 (pr/1138) (CM, reviewed by Thomas Phil) Improve handling of invalid TCK files, which could sometimes cause an infinite loop (pr/1140) (Anibal Solon, reviewed by CM) Clean up ECAT test case that left filehandle open and failed to use class variables (pr/1155) (Dimitri Papadopoulos, reviewed by CM) Maintenance Simplify TCK reading code by assuming files are open in binary mode (pr/1142) (Anibal Solon, reviewed by MC, CM) Code support for tests covering deprecated functionality (pr/1159) (CM) Miscellaneous code cleanups (pr/1148, pr/1149, pr/1153, pr/1154, pr/1156) (Dimitri Papadopoulos, reviewed by CM) Update CI to build, test and deploy PyPI artifacts (pr/1134) (CM, reviewed by MB) Transition from setup.cfg to pyproject.toml package configuration (pr/1133) (CM, reviewed by MB) Addressed race conditions preventing running tests with pytest-xdist. (pr/1157, pr/1158) (CM, reviewed by Christian Haselgrove) Apply blue and isort auto-formatters and provide pre-commit configuration to reduce human burden of style guidelines. (pr/1124, pr/1165, pr/1169) (CM and Zvi Baratz) Manage versioning with setuptools_scm (pr/1171) (CM, reviewed by Zvi Baratz) Reduce installed package size by excluding very large test file (pr/1176) (CM, reviewed by Zvi Baratz) API changes and deprecations Passing an int64 array to Nifti1Image without a header or dtype argument will raise a ValueError. (pr/1173) (CM) tmpdirs.TemporaryDirectory is deprecated in favor of tempfile.TemporaryDirectory. (pr/1172) (CM, reviewed by Zvi Baratz) The nisext package is deprecated and will be removed in NiBabel 6.0. (pr/1170) (CM, reviewed by MB) Drop support for Python 3.7, Numpy < 1.19 (pr/1177) (CM) The following deprecated functions and methods will now raise ExpiredDeprecationErrors nibabel.loadsave.read_img_data nibabel.dataobj_images.DataobjImage.get_data nibabel.loadsave.guessed_image_type nibabel.onetime.setattr_on_read nibabel.orientations.flip_axis Modules, classes and functions that expired at 4.0 were fully removed. ExpiredDeprecationError\s will now be AttributeError\s.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,270
Score d'incertitude au seuil0,905

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,007
Science ouverte0,0060,004
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2700,445

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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