High-coverage genomes of all extant penguin taxa
Notice bibliographique
Résumé
Penguins (Sphenisciformes) are a highly diverse order of seabirds distributed widely across the Southern Hemisphere. They shared a common ancestor with Procellariiformes about 60 million years ago, and have subsequently transited from flying seabirds to flightless marine divers. Approximately 20 extant penguin species are recognized across six well-defined genera, ranging from the Galapagos Islands on the equator, to the oceanic temperate forests of New Zealand, the rocky coastlines of the sub-Antarctic islands, and the sea-ice around Antarctica. To inhabit such diverse and extreme environments, this speciose order has evolved many physiological and morphological adaptations. However, penguins are also highly sensitive to climate change, and most species are already declining or are predicted to decline under future climate change scenarios. Therefore, penguins are an exciting system for understanding the evolutionary processes of speciation, adaptation and demography. Genomic data are an emerging resource for addressing questions about such processes. Here we present 19 new high-coverage genomes that, together with two previously published genomes also available in GigaDB, encompass all extant penguin species. As such, this dataset provides a novel resource for understanding the evolutionary history within penguins, and between penguins and other avifauna. We believe that our dataset and project will be important for cultural heritage and the conservation of this iconic Southern Hemisphere species assemblage. Comparative and evolutionary genomic analyses are currently being carried out, and the consortium welcomes new members interested in contributing to this work. While this work is still underway we have published these 19 penguin genomes to provide early-release, while requesting researchers intending to use this data for similar cross-species comparisons to continue to follow the Fort Lauderdale and Toronto rules.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,064 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».