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Enregistrement W6950618105 · doi:10.5281/zenodo.7875230

Diploneis limosa Jovanovska & Wilson & Hamilton & Stone 2023, sp. nov.

2023· article· en· W6950618105 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensCanadian Museum of Nature
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRapheApex (geometry)ExpansiveBent molecular geometryRegular polygon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diploneis limosa sp. nov. (LM Figs 582–608, SEM Figs 609–618) Valves are weakly asymmetric, linear-elliptic with parallel to weakly convex margins and round apices (Figs 582– 609). Valves become elliptic-circular with smaller cell size. Valve length is 12.5–33.5 μm and width is 9.5–14 μm. The axial area is very narrow, lanceolate, slightly expanding into a longitudinally elongate central area (Figs 584, 609, 610), 2.2–3.9 μm wide. Externally, the canal is linear to lanceolate, slightly expanded in the middle of the valve with one row of cribrate (<20 poroids) areolae that widens into two along the raphe branches and then narrows into one at the valve apices (Figs 582–585, 609, 611). Internally, a thick non-porous slightly raised silica plate encloses the longitudinal canal (Fig. 614). Externally, the raphe is filiform, curved; the proximal ends are deflected to one side and positioned within an expanded teardrop depression (Figs 609, 610, 611). The distal raphe ends are unilaterally bent to the same side as the proximal ends and terminate on the upper mantle at the apex (Figs 609, 611, 613). Internally, the raphe is curved with simple proximal and distal ends that are slightly elevated within a depression formed by the longitudinal canal (Figs 614, 616–618). The striae are parallel at mid-valve changing to radiate towards the apices, 12–14 in 10 μm. Striae are uniseriate becoming biseriate towards the valve margins (Fig. 612). The striae are composed of round recessed areolae covered externally with fine pored cribra (15–40 poroids), 15–20 in 10 μm. The areolae increase in size towards the valve margins (Figs 609, 611, 612). Internally, the alveoli open via a single elongated opening covered with a thin silica layer (Fig. 615). Type:— REPUBLIC OF ZAMBIA, Lake Mweru Wantipa, at 934 m elevation; floating plant roots, 0.1 m water depth, 8°33’33.2” S 29°56’15.4” E, E. Jovanovska & Z. Levkov, 3 rd October 2021 (holotype designated here, circled specimen BM-108974! = Fig. 583, isotypes ANSP-GC17203!, CANA-129327!). Type material CANA-129327. Registration: http://phycobank.org/103712 Pictures of the isolated specimen:— LM micrograph on 1000× magnification (Fig. S3r). Sequence data:— Plastid gene rbc L sequence (GenBank accession: OQ 660298). Etymology:— The specific epithet ‘ limosa ’ refers to Lake Mweru Wantipa or ‘muddy lake’ where the species was originally discovered. Ecology and distribution:— This species has only been observed in Lake Mweru-Wantipa, where the pH is neutral (7.3), the conductivity is high (1114 μS̔ cm-1), and the transparency of the water is very low. This was the only Diploneis species we found in the samples from the lake, and it was extremely abundant. Main differential characters:— Valve size and shape, striae pattern, striae density, and poroids up to 40 per areola. Similar species:— Diploneis fontium and D. calcifuga. Phylogenetic relationships ML and BI phylogenetic analyses on the single rbc L and concatenated rbc L+18S datasets revealed a nearly congruent topological pattern (Figs 620, S 5). The concatenated dataset yielded higher support for basal nodes than those inferred from the single locus dataset in both phylogenies. The two phylogenetic analyses supported monophyly of East African taxa with two distinct and well-supported clades, of which one clade included species from Lake Tanganyika (BS = 94 %, BPP = 1 for rbc L; BS = 93 %, BPP = 0.99 for rbc L+18S) and Diploneis limosa from Lake Mweru Wantipa as sister with 95 % BS support for both rbc L and rbc L+18S (Fig. 620). Within the Tanganyika clade, two entities remained unidentified, listed herein as Diploneis sp. 1 and Diploneis sp. 2 (see Table S1). The second clade consists of two species from Mulungushi River (BS = 73 %, BPP = 0.99 for rbc L; BS = 81 %; BPP = 0.99 for rbc L+18S). Support values within the Tanganyika clade and clade relationships are low in both analyses, but especially so in the ML analysis (BS <69 %). Therefore, neither BI nor ML support the morphological grouping of species based on valve outline and striae pattern, possibly due to low genetic coverage or genetic variation in both, rbc L and 18S, markers. All lineages differ by 0.05 nucleotide substitutions per site (overall mean p -distance) when assuming uniform rates for rbc L (Table S4).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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