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Enregistrement W6957676396 · doi:10.60645/bdc-7a8u-xuu0

NHLBI TOPMed: Evaluation of COPD Longitudinally to Identify Predictive Surrogate Endpoints (ECLIPSE)

2024· dataset· en· W6957676396 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueNHLBI BioData Catalyst · 2024
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCOPDSpirometrySputumObservational studyClinical endpointLongitudinal studyPulmonary function testing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ECLIPSE was a longitudinal observational study of 2164 COPD subjects and a smaller number of smoking controls (337) and nonsmoking controls (245) followed regularly for three years, with three chest CT scans (at baseline, one year, and three years) (Vestbo et al., 2008, PMID: [ 18216052](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18216052)). Subjects were enrolled at clinical centers in the US, Canada, Europe, and New Zealand. Inclusion criteria included subjects ages 40-75, at least 10 pack-years of smoking, and spirometry in GOLD grades 2-4 (COPD cases) or normal spirometry with post-bronchodilator FEV1 >85% (predicted) and FEV1/FVC>0.7 (controls). Study visits were performed at enrollment, three months, and every six months thereafter with spirometry, questionnaires, and other clinical evaluations. The ECLIPSE CT scans have been analyzed with the VIDA software for emphysema and airway phenotypes. ECLIPSE has provided key insights into the clinical epidemiology of COPD, including COPD exacerbations (Hurst, et. al., 2010, PMID: [ 20843247](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20843247)) and lung function decline in COPD (Vestbo, et. al., 2011, PMID: [ 21991892](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21991892)). ECLIPSE has been used in a number of genetic studies of COPD susceptibility and protein biomarkers (Faner, et. al., 2014, PMID: [ 24310110](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24310110)). Genome-wide gene expression microarray data are available in 147 induced sputum samples from COPD subjects and 248 peripheral blood samples from COPD and control subjects. Phenotype data for ECLIPSE subjects is available through dbGaP [phs001252](study.cgi?study_id=phs001252).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,179
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,183

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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