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Enregistrement W6958302414 · doi:10.6084/m9.figshare.26704080.v1

Additional file 12 of Purine salvage promotes treatment resistance in H3K27M-mutant diffuse midline glioma

2024· article· en· W6958302414 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell cultureCellMetaboliteAntibodyPurineIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 12: Supplemental Figure 10.15N-Gln and 2D-Hpx Isotope tracing of purine synthesis following RT. A.) Percent of tracer metabolite enrichment of 15N-Gln in H3K27M-isogenic cells 3hrs after 4Gy RT. B.) FC in 15N label enrichment in GMP in H3K27M-isogenic cell lines 3hrs after 4Gy single dose RT. RT conditions for each cell line are normalized to the respective 0Gy control. C.) FC in relative 15N-labeled GMP abundance between irradiated H3K27M-isogenic cell lines. Data are normalized to H3K27M-KO samples. D.) FC in 15N-labeled AMP ion abundance 3hrs after 4Gy single dose RT in H3K27M-isogenic cell lines. RT-treated samples were normalized to their respective unirradiated controls. E.) FC in the relative abundance of 15N-labeled AMP in DIPGXIII H3K27M-isogenic cell lines before (gray bars) and 3hrs after 4Gy RT (blue bars). Data are normalized to untreated control samples. F.) FC in relative 15N-labeled AMP abundance between irradiated H3K27M-isogenic cell lines.Data are normalized to H3K27M-KO samples. G.)Percent of tracer metabolite enrichment of 2D-Hpx in H3K27M-isogenic cells 3hrs after 4Gy RT. H.) FC in deuterium label enrichment in GMP in H3K27M-isogenic cell lines 3hrs after 4Gy single dose RT. RT conditions for each cell line are normalized to the respective 0Gy control. I.) FC in relative deuterium-labeled GMP abundance between irradiated H3K27M-isogenic cell lines. Data are normalized to H3K27M-KO samples. J.) FC in 2D-labeled AMP ion abundance 3hrs after 4Gy single dose RT in H3K27M-isogenic cell lines. RT-treated samples were normalized to their respective unirradiated controls. K.) FC in the relative abundance of 2D-labeled AMP in DIPGXIII H3K27M-isogenic cell lines before (gray bars) and 3hrs after 4Gy RT (blue bars). Data are normalized to untreated control samples. L.) FC in relative 2D-labeled AMP abundance between irradiated H3K27M-isogenic cell lines. Data are normalized to H3K27M-KO samples. Statistical analyses were performed using two-tailed t-tests in GraphPad Prism 10.0.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,861
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8610,199

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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