Additional file 1 of Predicting chemoresponsiveness in epithelial ovarian cancer patients using circulating small extracellular vesicle-derived plasma gelsolin
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Supplementary Figure 1. Distribution of individual biomarkers between chemoresistant (PFI ≤ 6 months) and chemosensitive (PFI > 6 months) groups using dot plots. Points on dot plots represent individual patient biomarker concentrations. Line with error bars represent group mean and SEM. (A) CA125, Mann-Whitney U-test. (B) Total pGSN, Student t-test. (C) sEV-pGSN, Mann-Whitney U-test. Supplementary Figure 2. Kaplan-Meier survival analysis (log-rank test) between total pGSN, sEV-pGSN, or total pGSN/sEV-pGSN with DFS or OS. Cut-off values were determined using Fisher’s exact test. (A) Total pGSN, DFS. (B) Total pGSN, OS. (C) sEV-pGSN, DFS. (D) sEV-pGSN, OS. (E) Total pGSN/sEV-pGSN, DFS. (F) Total pGSN/sEV-pGSN, OS. Supplementary Figure 3. Distribution of multi-analyte biomarkers between chemoresistant (PFI ≤ 6 months) and chemosensitive (PFI > 6 months) groups using dot plots. Points on dot plots represent individual patient biomarker concentrations. Line with error bars represent group mean and SEM. (A) Total pGSN/sEV-pGSN. (B) Total pGSN/CA125. (C) sEV-pGSN/CA125. (D) (Total pGSN/sEV-pGSN)/CA125. Mann-Whitney U-test used for all four multi-analyte biomarkers. Supplementary Figure 4. Receiver operating characteristic curve analysis for individual and multi-analyte biomarkers to predict PFI ≤ 6 months. (A) Total pGSN, sEV-pGSN, and total pGSN/sEV-pGSN. (B) CA125, total pGSN/CA125, sEV-pGSN/CA125, and (total pGSN/sEV-pGSN)/CA125. Supplementary Figure 5. Characterization of sEVs. (A) Western blot of sEV surface markers (CD9, CD63, and CD81), a cytoplasmic marker (GAPDH), and a negative sEV marker (calnexin). (B) Electron micrograph illustrating pGSN within extracellular vesicles. (C) Size distribution curve from nanoparticle tracking analysis of 5 representative samples. Bars represent mean particle count and error bars represent SEM.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,038 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,826 | 0,099 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».