Additional file 2 of Investigating the genetic architecture of disease resilience in pigs by genome-wide association studies of complete blood count traits collected from a natural disease challenge model
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 2: Figure S4. Multidimensional scaling (MDS) plots showing the first three dimensions (C1, C2, and C3) of the population structure for genotyped animals based on pairwise identity-by-state distance. Figure S5. (A) Manhattan plot for EOSB3. (B) Quantile-Quantile plot for EOSB3; Figure S6. (A) Manhattan plot for MONO ∆ 13. (B) Quantile-Quantile plot for MONO ∆ 13; Figure S7. Manhattan plots (A, C, E) and Quantile-Quantile plots (B, D, F) for MCH in Blood 1, Blood 3, and Blood 4, respectively; Figure S8. Manhattan plots (A, C) and Quantile-Quantile plots (B, D) for MCHC in Blood 3 and for the change of MCHC from Blood 1 to Blood 4, respectively; Figure S9. Manhattan plots (A, C, E) and Quantile-Quantile plots (B, D, F) for MCV in Blood 1, Blood 3, and Blood 4, respectively; Figure S10. Manhattan plots (A, C, E) and Quantile-Quantile plots (B, D, F) for RBC in Blood 1, Blood 3, and Blood 4, respectively; Figure S11. Manhattan plots (A, C) and Quantile-Quantile plots (B, D) for MPV in Blood 1 and Blood 4, respectively; Figure S12. Manhattan plots (A, C, E) and Quantile-Quantile plots (B, D, F) for PLT in Blood 1, Blood 3, and Blood 4, respectively.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,079 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».