Embracing Monogenic Parkinson's Disease: The MJFF Global Genetic PD Cohort
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background As gene‐targeted therapies are increasingly being developed for Parkinson's disease (PD), identifying and characterizing carriers of specific genetic pathogenic variants is imperative. Only a small fraction of the estimated number of subjects with monogenic PD worldwide are currently represented in the literature and availability of clinical data and clinical trial‐ready cohorts is limited. Objective The objectives are to (1) establish an international cohort of affected and unaffected individuals with PD‐linked variants; (2) provide harmonized and quality‐controlled clinical characterization data for each included individual; and (3) further promote collaboration of researchers in the field of monogenic PD. Methods We conducted a worldwide, systematic online survey to collect individual‐level data on individuals with PD‐linked variants in SNCA , LRRK2 , VPS35 , PRKN , PINK1 , DJ‐1 , as well as selected pathogenic and risk variants in GBA and corresponding demographic, clinical, and genetic data. All registered cases underwent thorough quality checks, and pathogenicity scoring of the variants and genotype–phenotype relationships were analyzed. Results We collected 3888 variant carriers for our analyses, reported by 92 centers (42 countries) worldwide. Of the included individuals, 3185 had a diagnosis of PD (ie, 1306 LRRK2 , 115 SNCA , 23 VPS35 , 429 PRKN , 75 PINK1 , 13 DJ‐1 , and 1224 GBA ) and 703 were unaffected (ie, 328 LRRK2 , 32 SNCA , 3 VPS35 , 1 PRKN , 1 PINK1 , and 338 GBA ). In total, we identified 269 different pathogenic variants; 1322 individuals in our cohort (34%) were indicated as not previously published. Conclusions Within the MJFF Global Genetic PD Study Group, we (1) established the largest international cohort of affected and unaffected individuals carrying PD‐linked variants; (2) provide harmonized and quality‐controlled clinical and genetic data for each included individual; (3) promote collaboration in the field of genetic PD with a view toward clinical and genetic stratification of patients for gene‐targeted clinical trials. © 2023 The Authors. Movement Disorders published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson and Movement Disorder Society.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».