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Enregistrement W6958431924 · doi:10.6084/m9.figshare.26563180.v1

Additional file 1 of Lab and field evaluation of tagging methods for the use of acoustic telemetry to observe sea urchin movement behaviour at ecologically relevant spatio-temporal scales

2024· article· en· W6958431924 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversité LavalFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStrongylocentrotus droebachiensisSea urchinPolygon (computer graphics)Table (database)TelemetryPoint (geometry)Regular polygon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1: Details of tagging methods. Figure S1. Number of nylon screw tagged urchins (green dashed line) and number of hole urchins (orange solid line) through time (days post-tagging), showing that hole urchins are almost entirely composed of nylon screw tagged urchins that have lost their tags (sum of the two groups is always equal or close to the 80 individuals initially tagged with nylon screws). Figure S2. The effect of including more points (increasing the percentage included) on minimum convex polygon area. Estimated areas for 10% to 90% of points are shown, coloured by month of observation. Vertical dashed line indicates the chosen cut-off point (75%) where the small percentage of points very far from the majority cause a steep increase in estimated area. This should ensure that large-error points are excluded from these estimates, while retaining points which represent actual movement and space use by individual urchins. Figure S3. Larger urchins take more time to right themselves than smaller urchins (significant effect of diameter), although there is significant variability between individuals and measures; points and predictions are from Control urchins only. Table S1. Parameter estimates (beta coefficients) from models, with 95% confidence intervals. Figure S4. Test diameter (mm) of urchins before tagging and at the end of the experiment after 3.5 months. Because of mortality and tag loss, the number of individuals in each group after 3.5 months is less than at the beginning, except for the Hole treatment. Significant differences between tagging treatments from post-hoc comparisons are shown with different letters. Figure S5. Gonad weight as a function of tagging treatment. There were no significant differences between tagging treatments. Figure S6. Relationship between gonad wet weight and test diameter for all tagging treatments. Model results (predicted values and 95% Confidence Intervals) are shown. Figure S7. Injuries observed through time as a function of tagging method. No mortality and only two injuries were observed in control urchins. Because injuries could only be followed and definitively assigned to a tagging method as long as the tag was attached, the number of urchins removed from these observations at each time period is shown as the category “Tag lost or urchin dead”. For example, the small number of injuries assigned to the Nylon screw tagging method is a function of the high mortality and high tag loss seen in this treatment; these urchins are also shown in the Hole tag treatment here, as urchins with Very apparent injuries. Figure S8. Net displacement of tagged individuals after 2 days in the field calculated from diver observations. Figure S9. Number of observations per tagged individual. The two tagging methods are shown as different shapes and colours, while release point ‘a’ and ‘b’ are the top and bottom panels, respectively. Points are shown for the total number of observations filtered by the positioning error (HPE). All urchins have at least one point (not filtered: largest and palest point) although for certain individuals that were never detected by the array (ID 10 and 11) this is zero. Successively darker and smaller points are filtered by lower HPE values. Size of the points is scaled by the HPE filter (points filtered by larger values, are larger). Note the different y-axis scales for the two panels. Figure S10. Minimum convex polygons (MCPs) per month for each individual. Points are all detections (HPE < 200), polygons are monthly 75% MCPs and numbers in the upper right of each panel are the MCP area per month in m2. a) Fishing line tagged urchins and b) T-bar-tagged urchins. The detached reference tag is shown in both a and b (id #31) for comparison.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,027
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,798
Score d'incertitude au seuil0,287

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,027
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,7980,174

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,108
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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