Additional file 1 of A therapeutic target for CKD: activin A facilitates TGFβ1 profibrotic signaling
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1. Follistatin does not inhibit early Smad3 activation by TGFβ1. MC were treated with follistatin for 30 min prior to the addition of TGFβ1 for 30 min. Smad3 phosphorylation was assessed by immunoblotting. ****P < 0.0001; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S2. Activin A supports TGFβ1 profibrotic effects in renal fibroblasts. Follistatin (FST) and actA neutralization attenuated TGFβ1-induced fibronectin (FN), α-smooth muscle actin (αSMA) and connective tissue growth factor (CTGF) upregulation as well as Smad3 activation at 48 h (n = 5–8). *, **, ***, ****P < 0.05, 0.01, 0.001, 0.000; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S3. Confirmation of specificity of the actA neutralizing antibody in MC. The neutralizing antibody for actA prevents actA, but not actB, induction of Smad3 transcriptional activity at 24 h as assessed by the CAGA12 luciferase reporter (n = 6). **, ****P < 0.01, 0.0001; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S4. ActA inhibition prevents profibrotic gene upregulation by TGFβ1 in MC. Increased fibronectin (FN), collagen Iα1 (ColI) and α-smooth muscle actin (αSMA) transcripts by 24 h of TGFβ1 were attenuated with a neutralizing actA antibody (n = 6). **, ***P < 0.01, 0.001; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S5. ActA enables renal fibroblast proliferation, migration and gel contraction. (a) Increased cell proliferation induced by TGFβ1 (24 h) is significantly decreased by both follistatin and a neutralizing actA antibody (n = 3). (b) TGFβ1 increased wound closure after 24 h in a scratch assay. This was inhibited by both follistatin and an actA neutralizing antibody (n = 3). (c) TGFβ1 induced collagen gel contraction after 72 h, which was prevented by follistatin and an actA neutralizing antibody (n = 3). *, **P < 0.05, 0.01; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S6. TGFβ1 induces activin A, but not activin B production in human proximal tubular cells. TGFβ1: (a) upregulates actA, but not actB, transcript levels at 24 h (n = 6–9); (b) induces actA secretion in a dose-dependant manner (0.5–5 ng/ml TGFβ1) (n = 3); (c) has no effect on actB secretion at 24 h (n = 3). **, ***, ****P < 0.01, 0.001, 0.0001; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S7. TGFβ3 induces actA synthesis and secretion in MC. ELISA shows a small increase in both a) actA secretion into the medium (n = 3) and b) cellular actA levels in response to 24 h of TGFβ3 treatment (n = 3). **P < 0.01; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S8. In MC, 24 h TGFβ1 increases transcript levels for activin type I and II receptors ALK4 and ActRIIA/B respectively. This is dependent on activin signaling itself as it is inhibited by follistatin (n = 3). *, **, ***P < 0.05, 0.01, 0.001; one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test. Figure S9. ActA does not regulate the activation of Smad2 by TGFβ1 in MC. Smad2 activation was assessed by its phosphorylation after 24 h of TGFβ1. Neither follistatin nor the actA neutralizing antibody prevented its activation (n = 3); one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparisons post hoc test.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,025 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,906 | 0,158 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».