Additional file 5 of Changes in concentrations of cervicovaginal immune mediators across the menstrual cycle: a systematic review and meta-analysis of individual patient data
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 5: Figure S1. Assessment of publication bias. A Funnel plots. Symbols show the effect of the menstrual cycle (x-axis) and the standard error of that effect (y-axis, reversed). Each symbol shows an individual study. Vertical solid line shows no effect. Vertical dashed line shows the meta-estimate of effect. Diagonal dashed lines enclose the region expected to include 95% of studies based on the estimated meta-effect and the standard errors. B Results of Egger’s tests for publication bias. Figure S2. Periovulatory meta-analyses. A The log2 difference between periovulatory and follicular phases (log2-pg/mL of the follicular phase minus log2-pg/mL of the periovulatory phase). For TGF-β1, the error bars for one study and the meta-estimate extend off-scale. B The log2 difference between periovulatory and luteal phases (log2-pg/mL of the luteal phase minus log2-pg/mL of the periovulatory phase). For IL-10, the error bars for one study extend off-scale. Each row represents a different immune mediator, with the symbols showing the mean and the lines showing the 95% confidence intervals. Gray symbols indicate individual studies and black the meta-estimates as determined by inverse-variance pooling random effects models. Black filled symbols indicate p < 0.05 while white filled symbols indicate p > 0.05. Positive numbers indicate higher during the follicular or luteal phase, while negative numbers indicate higher during the periovulatory phase. Fig S3. Subgroup analysis: Does the effect of menstrual cycle differ by assay method, geographical region, or method of determining menstrual phase? A Meta-analyses, comparing all studies (black circles) to studies grouped by assay method (ELISA: blue squares; MSD: yellow triangles; Luminex: green diamonds). B Meta-analyses, comparing all studies (black circles) to studies grouped by geographical region of sample origin (Africa: blue diamonds; Europe: red squares; North America: green triangles). C Meta-analyses, comparing all studies (black circles) to studies grouped by method of menstrual cycle phasing (Days since LMP: orange squares; Progesterone: pale purple diamonds; Progesterone plus LH: dark purple triangles). Figure S4. Secondary outcomes: Method of determining menstrual cycle phase and normalization to total protein. A The standard errors of the effect sizes for the difference between menstrual cycle phases, with phases determined by days since last menstrual period (“LMP”) or serum progesterone (“Prog”). Each symbol represents an immune factor, with lines connecting the same immune factor. B The standard errors of the effect sizes for the difference between menstrual cycle phases as determined using raw concentration measurements (pg/mL) and concentrations normalized to total protein (pg/pg total protein). Each symbol represents an immune factor, with lines connecting the same immune factor. Table S1. Summary of immune mediators measured in single studies. Table S2. Summary of follicular vs. periovulatory meta-analyses. Table S3. Summary of luteal vs. periovulatory meta-analyses. Table S4. Covariates adjusted for in multivariate analysis of each study.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,054 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,005 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,785 | 0,026 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».