Additional file 6 of A minimized symbiotic gene set from the 1.68 Mb pSymB chromid of Sinorhizobium meliloti reveals auxiliary symbiotic loci
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 6: Fig. S4. Symbiotic phenotype of key strains on the alternate S. meliloti host Melilotus officinalis (yellow sweet clover) and the consistent nodule morphology of exclusively Fix− SmB1.0 nodules. (A) The shoot dry weight of M. officinalis inoculated with SmB1.0 was consistently Fix− and indistinguishable from un-inoculated controls (red). This appears to be due to the simultaneous removal of the B301 and B307 regions as seen when M. officinalis is inoculated with SmB1.0+ pSymBΔB302ΔB307. The addition of pSymBΔB302 to SmB1.0 was able to restore the symbiosis wild-type levels as was seen with alfalfa (light blue). SmB2.0 was Fix+ with M. officinalis at a level below that seen with alfalfa (orange). Mean shoot height differences were assessed using one-way ANOVA followed by a Tukey multiple comparison test. (B-D) Wild-type-inoculated nodules of M. officinalis 5 weeks post-inoculation displayed typical development with highly elongated bacteroids. (E-J) SmB1.0-inoculated nodules of M. officinalis 5 weeks post-inoculation exhibited consistent early arrest of nodule development (E-F, further magnified in G) with poorly elongated bacteria (H). Proximal part of the nodule was often devoid of infected cells and possessed numerous infection threads (I-J). Nodules were fixed and stained with the DNA-binding dye SYTO13. Images are representative of a minimum of five independent nodules examined. Scale bars: (B, E-G) 100 μm; (C-D, H-J) 25 μm. Arrowheads point to examples of bacteria in infection threads.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,037 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,987 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».