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Enregistrement W6958798623 · doi:10.6084/m9.figshare.26612009

Additional file 1 of FGF1 supports glycolytic metabolism through the estrogen receptor in endocrine-resistant and obesity-associated breast cancer

2024· article· en· W6958798623 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueLegal and Regulatory Analysis
Établissements canadiensJewish General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerFGF1Estrogen receptorCancerFulvestrantMultiplexCancer cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1. Fig. S1 Analysis of human breast tumors. Kaplan–Meier curves of recurrence-free survival percent for all patients with breast cancer (A-B) or patients with ER-negative breast cancer (C-D) based on high or low SLC16A3/MCT4 (left) or GFM2 (right). Data analyzed by log rank test. Fig. S2 Steady-state phospho-proteomics analysis of ER-positive breast cancer cells. (A) Heatmap shows the hierarchical clustering of protein phospho-site abundance normalized to total protein data in MCF7 and MCF7 TAMR cells treated with Veh, E2 (10nM), or FGF1 (5ng/mL) for 15 minutes, emphasizing enriched phospho-proteins in E2-treated conditions. (B) Diagram of residues phosphorylated in MCF7 TAMR (green) versus MCF7 (pink) cells. (C) Heatmap shows the hierarchical clustering of protein phospho-site abundance normalized to total protein data in MCF7 and MCF7 TAMR cells treated with Veh, E2 (10nM), or FGF1 (5ng/mL) for 15 minutes, emphasizing enriched phospho-proteins in FGF1-treated conditions. (D) Diagram of residues phosphorylated in MCF7 TAMR (green) versus MCF7 (pink) cells treated with FGF1. For both diagrams, red sites are more phosphorylated in MCF7 TAMR and blue sites are more phosphorylated in MCF7 (decreased in MCF7 TAMR) in vehicle control conditions. The connecting lines represent high-stringency protein–protein interactions identified using STRING network analysis (see "Methods"). Fig. S3 Analysis of MAPK and ER in breast cancer cells. Full representative capillary immunoblot images of multiplex evaluation of vinculin (loading control), pER-S118, pER-S167, total ER, pMAPK, or total MAPK in MCF7 cells, MCF7 TAMR cells, or UCD12 cells treated with vehicle (Veh), E2 (10 nM), FGF1 (5 ng/mL), or E2+FGF1 for 15 minutes following an overnight starve. Fig. S4 Analysis of UCD12 tumors from LF- and HF-fed mice. (A) Light exposure capillary immunoblot images of pER-S118 along with pMAPK (top), or total ER along with total MAPK (bottom) in UCD12 tumor lysates from LF- or HF-fed mice treated with E2 or EWD. N=3 separate tumors per group. (B) Full representative capillary immunoblot image of UCD12 tumor lysates at a light exposure to show vinculin loading control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,982
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,9820,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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