Additional file 1 of CSF total and oligomeric α-Synuclein along with TNF-α as risk biomarkers for Parkinson’s disease: a study in LRRK2 mutation carriers
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Supplementary Table 1. Associations between CSF biomarkers. No correlation between CSF biomarkers were present in symptomatic LRRK2 mutation carriers group alone. Both sPD and symptomatic LRRK2 mutation carriers groups were combined as one PD group. Associations between CSF biomarkers were assessed with Spearman correlation coefficients. Data shown as r. Significance: *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05 Aβ1–42, amyloid β1–42; Ctrl, Healthy controls; o-α-syn, oligomeric α-synuclein; pSer129-α-synuclein, phosphorylated α-synuclein protein at serine 129; pTau, tau phosphorylated at threonine 181; PD, Parkinson’s disease patients; tTau, total tau protein; and t-α-syn, total α-synuclein. Supplementary Table 2. Associations between CSF α-syn species and clinical parameters. Associations between CSF biomarkers were assessed with Spearman correlation coefficients. Data shown as r. Significance: *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. Both sPD and symptomatic LRRK2 mutation carriers groups were combined as one PD group. Aβ1–42, amyloid β1–42; Ctrl, healthy controls; H&Y, Hoehn and Yahr scale; MoCA, Montreal Cognitive Assessment; NA, not applicable; o-α-syn, oligomeric α-synuclein; pSer129-α-synuclein, phosphorylated α-synuclein protein at serine 129; pTau, tau phosphorylated at threonine 181; sPD, sporadic PD; TNF-α, tumor necrosis factor-alpha; tTau, total tau protein; t-α-syn, total α-synuclein; UPDRS-III, Unified Parkinson’s Disease Rating Scale. Supplementary Table 3. Discriminant loadings for each individual predictor. The correlation coefficient represents the relative contribution for each predictor to group separation. IL-16, interlukin-16; o-α-syn, α-synuclein oligomers; pS129-α-syn, phosphorylated Ser 129 α-synuclein; t-α-syn, total α-synuclein; TNF- α, tumor necrosis factor- α.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,026 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,825 | 0,086 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».