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Enregistrement W6958812639 · doi:10.6084/m9.figshare.c.7409148

The causal relationship between gut microbiota and constipation: a two-sample Mendelian randomization study

2024· other· en· W6958812639 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typeother
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMendelian randomizationGut floraObservational studyCausality (physics)ConstipationOdds ratioPleiotropyConfounding

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Constipation is one of the most common gastrointestinal disorders afflicting the population, with recent observational studies implicating dysfunction of the gut microbiota in constipation. Despite observational studies indicating a relationship, a clear causality remains unclear. This study aims to use two-sample Mendelian randomization (MR) to establish a clearer causal relationship between the two. Methods A two-sample Mendelian randomization (MR) study was performed using the gut microbiota summary Genome-Wide Association Studies (GWAS) statistics from MiBioGen consortium (n = 13,266) and constipation GWAS summary statistics from the IEU OpenGWAS database. The causality between gut microbiota and constipation is primarily analyzed using the inverse-variance weighted (IVW) method and reinforced by an additional four methods, including MR-Egger, Weighted Median, Simple Mode, and Weighted Mode. Finally, funnel plot, heterogeneity test, horizontal pleiotropy test, and leave-one-out test were used to evaluate the reliability of MR results. Results IVW estimates suggested that the bacterial species Anaerotruncus, Butyricimonas, and Hungatella were causally associated with constipation. The odds ratio (OR) values of Anaerotruncus, Butyricimonas, and Hungatella were 1.08 (95% CI = 1.02–1.13; P = 0.007), 1.07 (95% CI = 1.01–1.13; P = 0.015), 1.03 (95% CI = 1.00-1.06; P = 0.037) respectively. Meanwhile, Ruminiclostridium 9 and Intestinibacter have been shown to be associated with a reduced risk of constipation. The OR of Ruminiclostridium 9 = 0.75(95% CI = 0.73–0.78, P < 0.001 and Intestinibacter of OR = 0.89 (95% CI = 0.86–0.93, P < 0.001). Furthermore, validation by funnel plot, heterogeneity test, and horizontal pleiotropy test showed that MR results were reliable. Conclusion This is the first Mendelian randomization study to explore the causalities between specific gut microbiota taxa and constipation, and as such may be useful in providing insights into the unclear pathology of constipation which can in turn aid in the search for prevention and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,621
Score d'incertitude au seuil0,985

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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