Additional file 2: Table S1. of A novel strain of cynomolgus macaque cytomegalovirus: implications for host-virus co-evolution
Notice bibliographique
Résumé
ORFs of CyCMV Mauritius. Footnotes: 1 Functions annotated based on studies of HCMV [52] unless otherwise indicated. 2 Nearest homologous HCMV gene based on Bit score using BLASTP search. Strain of HCMV gene indicated with footnote. 3 Based on function of RhCMV68-1 homologue [19]. 4 Based on function of CyCMV Ottawa homologue [18]. 5 Based on studies of HCMV Towne-BAC [54]. 6 Inferred through function of homologous proteins [52]. 8 HCMV strain AD169. 9 HCMV strain AF1. 10 HCMV strain ASM72. 11 HCMV strain C154. 12 HCMV strain C425, 13 HCMV strain CINCYâ +â Towne. 14 HCMV strain Coz. 15 HCMV strain David. 16 HCMV strain FRCMV-14L. 17 HCMV strain GSV6. 18 HCMV strain GSV9. 19 HCMV strain HAN1. 20 HCMV strain HAN13. 21 HCMV strain HAN16. 22 HCMV strain HAN20. 23 HCMV strain HAN3. 24 HCMV strain HAN38. 25 HCMV strain HKS40. 26 HCMV strain I-10. 27 HCMV strain IS17. 28 HCMV strain JHC. 29 HCMV strain JP. 30 HCMV strain L2. 31 HCMV strain Merlin. 32 HCMV strain RK (Human Herpesvirus 7). 33 HCMV strain TB40/E. 34 HCMV strain Toledo. 35 HCMV strain Towne. 36 HCMV strain TR. 37 HCMV strain U11. 38 HCMV strain U8. 39 HCMV strain VR1814. 40 HCMV strain 35. 41 HCMV strain 66. 42 HCMV strain 452. 43 HCMV strain 553. 44 HCMV strain 3157. 45 HCMV strain 3301. 46 HCMV strain 5234. 47 HCMV strain 401058. 48 HCMV strain 26M. 49 HCMV strain 51C. (PDF 158 kb)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,871 | 0,212 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».