Modulation of defense genes and phenolic compounds in wild blueberry in response to Botrytis cinerea under field conditions
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Botrytis blight is an important disease of wild blueberry [(Vaccinium angustifolium (Va) and V. myrtilloides (Vm))] with variable symptoms in the field due to differences in susceptibility among blueberry phenotypes. Representative blueberry plants of varying phenotypes were inoculated with spores of B. cinerea. The relative expression of pathogenesis-related genes (PR3, PR4), flavonoid biosynthesis genes, and estimation of the concentration of ten phenolic compounds between uninoculated and inoculated samples at different time points were analyzed. Representative plants of six phenotypes (brown stem Va, green stem Va, Va f. nigrum, tall, medium, and short stems of Vm) were collected and studied using qRT-PCR. The expression of targeted genes indicated a response of inoculated plants to B. cinerea at either 12, 24, 48 or 96 h post inoculation (hpi). The maximum expression of PR3 occurred at 24 hpi in all the phenotypes except Va f. nigrum and tall stem Vm. Maximum expression of both PR genes occurred at 12 hpi in Va f. nigrum. Chalcone synthase, flavonol synthase and anthocyanin synthase were suppressed at 12 hpi followed by an upregulation at 24 hpi. The expression of flavonoid pathway genes was phenotype-specific with their regulation patterns showing temporal differences among the phenotypes. Phenolic compound accumulation was temporally regulated at different post-inoculation time points. M-coumaric acid and kaempferol-3-glucoside are the compounds that were increased with B. cinerea inoculation. Results from this study suggest that the expression of PR and flavonoid genes, and the accumulation of phenolic compounds associated with B. cinerea infection could be phenotype specific. This study may provide a starting point for understanding and determining the mechanisms governing the wild blueberry-B. cinerea pathosystem.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».