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Enregistrement W6959215833 · doi:10.1021/acs.jproteome.8b00117.s001

Genetic Variation\nin 9p21 and the Plasma Proteome

2018· article· en· W6959215833 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApolipoprotein BGenotypeDiseaseProteomeBlood proteinsSingle-nucleotide polymorphismGenetic variationNutrigenomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single nucleotide polymorphisms (SNPs)\nin the noncoding region\nof 9p21 have been associated with cardiovascular disease (CVD), but\nthe mechanisms by which these genetic variants contribute to the pathogenesis\nof CVD remain unknown since no annotated proteins are present in this\nregion of DNA. The objective of the current study was to determine\nif 9p21 genotypes are associated with distinct plasma proteins in\nyoung adults. Subjects were 1611 young adults aged 20–29 years\nfrom the Toronto Nutrigenomics and Health Study (1098 females and\n513 males). DNA was isolated from fasting blood to analyze four SNPs\nin 9p21 (rs2383206, rs10757274, rs10757278, and rs1333049). Abundant\nplasma proteins (<i>n</i> = 54) were measured using liquid\nchromatography multiple reaction monitoring mass spectrometry. Analysis\nof covariance was used to determine differences in plasma proteins\nbetween genotypes. In Caucasians (<i>n</i> = 524), four\nSNPs were associated with apolipoprotein E and two with haptoglobin-β-chain\nconcentration. In East Asians (<i>n</i> = 388), three SNPs\nwere associated with α-1b-Glycoprotein, two with apolipoprotein\nB-100, one with apolipoprotein E and one with haptoglobin-β-chain\nconcentration. In South Asians (<i>n</i> = 117), one SNP\nwas associated with apolipoprotein B-100 concentration. Our findings\nsuggest that 9p21 genotypes may play a role in various pathophysiological\npathways that contribute to risk of CVD in early adulthood that might\nbe distinct among different ethnocultural groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,667
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0460,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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