Genetic Variation\nin 9p21 and the Plasma Proteome
Notice bibliographique
Résumé
Single nucleotide polymorphisms (SNPs)\nin the noncoding region\nof 9p21 have been associated with cardiovascular disease (CVD), but\nthe mechanisms by which these genetic variants contribute to the pathogenesis\nof CVD remain unknown since no annotated proteins are present in this\nregion of DNA. The objective of the current study was to determine\nif 9p21 genotypes are associated with distinct plasma proteins in\nyoung adults. Subjects were 1611 young adults aged 20–29 years\nfrom the Toronto Nutrigenomics and Health Study (1098 females and\n513 males). DNA was isolated from fasting blood to analyze four SNPs\nin 9p21 (rs2383206, rs10757274, rs10757278, and rs1333049). Abundant\nplasma proteins (<i>n</i> = 54) were measured using liquid\nchromatography multiple reaction monitoring mass spectrometry. Analysis\nof covariance was used to determine differences in plasma proteins\nbetween genotypes. In Caucasians (<i>n</i> = 524), four\nSNPs were associated with apolipoprotein E and two with haptoglobin-β-chain\nconcentration. In East Asians (<i>n</i> = 388), three SNPs\nwere associated with α-1b-Glycoprotein, two with apolipoprotein\nB-100, one with apolipoprotein E and one with haptoglobin-β-chain\nconcentration. In South Asians (<i>n</i> = 117), one SNP\nwas associated with apolipoprotein B-100 concentration. Our findings\nsuggest that 9p21 genotypes may play a role in various pathophysiological\npathways that contribute to risk of CVD in early adulthood that might\nbe distinct among different ethnocultural groups.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,046 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».