MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6959358316 · doi:10.7939/r3-kq8d-ba45

Fusarium root rot of canola (Brassica napus): Occurrence, pathogenicity and yield losses in Alberta, Canada

2024· dissertation· en· W6959358316 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUniversity of Alberta Library · 2024
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusarium proliferatumCanolaRoot rotFusariumInternal transcribed spacerInoculationFusarium oxysporumGibberella

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Root rot is a soilborne disease of canola (Brassica napus) caused by a pathogen complex. Canola crops were surveyed in Alberta, Canada, in 2021 and 2022 to assess the composition and diversity of fungi associated with root rot in this region. Isolates were identified to genus and/or species based on colony and morphological characteristics, with Fusarium spp. found to be predominant. The identity of Fusarium spp. was confirmed by analysis of the translation elongation factor 1-α (TEF-1α) and internal transcribed spacer (ITS) sequences. Fusarium avenaceum was recovered most frequently, followed by F. redolens and F. solani. Most isolates caused moderate to severe disease on canola under greenhouse conditions, with F. avenaceum and F. sporotrichioides among the most aggressive species. Fusarium sporotrichioides and F. commune were identified for the first time as canola root rot pathogens. Principal component analysis demonstrated the utility of combining disease severity and growth measurements in assessments of pathogenicity. Analysis of the ITS sequence successfully distinguished various Fusarium species, with the exception of closely related phylogenetic species like F. avenaceum, F. acuminatum, and Fusarium tricinctum. The TEF-1α sequence analysis facilitated species differentiation. Concatenating the ITS and TEF-1α sequences provided more diversified grouping information. No geographic or year effects were observed on fungal diversity or aggressiveness. In another study, the impact of F. avenaceum and Fusarium proliferatum on canola yields was evaluated in field and greenhouse experiments, and the interaction between F. proliferatum and F. oxysporum was also explored. Inoculation with any of the three species resulted in significant disease severity and reduced seedling emergence compared with non-inoculated controls, leading to yield reductions of up to 35%. Notably, there was a strong correlation (r = 0.93) between root rot severity at the seedling stage and at maturity. Regression analysis indicated a linear decline in emergence with increasing disease severity. Furthermore, disease severity at maturity adversely affected pod number per plant and seed weight per plant, with both parameters ultimately reaching zero at a severity of four on a 0-4 scale. Co-inoculation with F. oxysporum and F. proliferatum induced more severe root rot than inoculation with each species on its own, suggesting synergistic interactions between these fungi. In a final study, the host range of F. proliferatum was investigated through greenhouse inoculation experiments involving wheat, barley, faba bean, pea, lentil, canola, lupine and soybean. All crops were at least partly susceptible, developing mild to severe root rot at the seedling and adult plant stages, and showing significant reductions in growth. In general, barley and wheat demonstrated higher tolerance to infection, followed by faba bean and pea. Soybean, canola, lupine, and lentil were most susceptible. Canola and soybean were particularly vulnerable to F. proliferatum at the pre-emergence stage, while infection greatly reduced lentil biomass. Reductions in barley emergence and other growth parameters, however, occurred only under a high inoculum concentration. Understanding the identity, pathogenicity, and relative prevalence of Fusarium spp., along with improved knowledge of their impact on yields, will contribute to better management of canola root rot.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil0,461

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,160
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueUniversity of Alberta LibraryMême sujetPlant Disease Resistance and GeneticsTravaux en français237 207