Adaptation of a Commonly Used, Chemically Defined\nMedium for Human Embryonic Stem Cells to Stable Isotope Labeling with\nAmino Acids in Cell Culture
Notice bibliographique
Résumé
Metabolic\nlabeling with stable isotopes is a prominent technique\nfor comparative quantitative proteomics, and stable isotope labeling\nwith amino acids in cell culture (SILAC) is the most commonly used\napproach. SILAC is, however, traditionally limited to simple tissue\nculture regimens and only rarely employed in the context of complex\nculturing conditions as those required for human embryonic stem cells\n(hESCs). Classic hESC culture is based on the use of mouse embryonic\nfibroblasts (MEFs) as a feeder layer, and as a result, possible xenogeneic\ncontamination, contribution of unlabeled amino acids by the feeders,\ninterlaboratory variability of MEF preparation, and the overall complexity\nof the culture system are all of concern in conjunction with SILAC.\nWe demonstrate a feeder-free SILAC culture system based on a customized\nversion of a commonly used, chemically defined hESC medium developed\nby Ludwig et al. and commercially available as mTeSR1 [mTeSR1 is a\ntrade mark of WiCell (Madison, WI) licensed to STEMCELL Technologies\n(Vancouver, Canada)]. This medium, together with adjustments to the\nculturing protocol, facilitates reproducible labeling that is easily\nscalable to the protein amounts required by proteomic work flows.\nIt greatly enhances the usability of quantitative proteomics as a\ntool for the study of mechanisms underlying hESCs differentiation\nand self-renewal. Associated data have been deposited to the ProteomeXchange\nwith the identifier PXD000151.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».