Bayesian tree of 263 HIV-1 subtype B sequences of the pol gene from 25 American countries.
Notice bibliographique
Résumé
<p>Majority-rule Bayesian consensus tree of 268 HIV-1 subtype B <i>pol</i> sequences isolated in 25 countries in the Americas. The outgroups are subtypes C and D. Branches are colored according to the sample origin. Orange branches represent isolates from the Caribbean, the green branches represent South American isolates, and the blue branches represent isolates from North America. Posterior probabilities are shown for the key nodes. The tips of the tree contain isolate information regarding the subtype, country, year of isolation, and GenBank accession number. Abbreviations of countries are as follows: AR, Argentina; AG, Antigua and Barbuda; BH, Bahamas; BR, Brazil; BW, Botswana; CA, Canada; CD, Democratic Congo; CM, Cameroon; CO, Colombia; CU, Cuba; DO, Dominican Republic; EC, Ecuador; ET, Ethiopia; GD, Grenada; GY, Guyana; HT, Haiti; JM, Jamaica; LC, Santa Lucia; SR, Suriname; TT, Trinidad and Tobago; TZ, Tanzania; UG, Uganda; US, United States; VC, St Vincent; VE, Venezuela.</p>
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,263 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».