A journey from India to Canada : the westernization of the gut microbiome is associated with dietary acculturation in Indian migrants
Notice bibliographique
Résumé
The growing immigrant population in North America are experiencing westernization at a rapid rate. Amidst the backdrop of rising immigration, health disparities are emerging in immigrants, including several modern diseases linked with the westernized lifestyle. Young Indian immigrants and Indo-Canadians face a significantly higher risk of inflammatory bowel disease (IBD) in westernized countries. While the root causes of IBD are not entirely understood, a main characteristic is an imbalanced gut microbiome no longer in symbiosis with its host. However, Indian populations are underrepresented in microbiome studies, making it challenging to determine the influences of their gut microbiome in this increased IBD risk. To understand why Indians are more vulnerable to IBD in Canada, it is essential to first investigate their gut microbiome. This thesis explores the gut microbiome transition in Indian migrants in Canada by characterizing their microbial composition, and the impact of their dietary patterns on the microbiome. Using 16S and shotgun sequencing data obtained from stool samples of healthy subjects, our study compares the microbiome of Indians residing in India, Indian immigrants, and Indo-Canadians, with Euro-Canadians and Euro-Immigrants as westernized controls. Our findings reveal significant differences in microbiota composition among these groups, with Indian residents showing a distinctive gut microbiota rich in Prevotella spp., whereas Indo-Canadians resembled more of an industrialized gut, with higher Bacteroides spp. abundance. While Indo-Immigrants had a gut microbiota that was distinct from Indians and westernized cohorts, some subjects displayed moderate levels of Prevotella spp. abundances, which may be due to their mixed diet that included both traditional Indian and westernized foods. This study concludes that Indo-Canadians undergo a marked transition towards an industrialized microbiome within just one generation, both through functional changes and the loss of Prevotella spp. This microbiota transition was associated with a large change in dietary habits, in particular a decrease in a high carbohydrate, high fibre diet, and an increase in ultra-processed foods. Overall, the data shown offers insight into how migration and lifestyle changes affect both microbial composition and functions in the gut, and their implications for understanding immigrant-health outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,006 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».