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Enregistrement W6961415576 · doi:10.14288/1.0165939

Replicate divergence between and within sounds in a marine fish : the copper rockfish (Sebastes caurinus)

2014· article· en· W6961415576 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueOpen Collections · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiological dispersalInletPopulationPanmixiaBayGenetic structureSebastesEstuaryGenetic divergence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the factors that influence larval dispersal and connectivity among marine populations is critical to the conservation and sustainable management of marine resources. Whereas marine populations were once thought to be panmictic through extensive larval exchange, recent studies are increasingly uncovering fine-scale substructure driven by contemporary features of the seascape such as coastal topography, bathymetry, and nearshore currents. In this study I tested the degree of genetic subdivision among ten populations of copper rockfish (Sebastes caurinus) representing paired samples collected from inlets and adjacent outer coast habitats in five replicate sounds on the west coast of Vancouver Island, British Columbia, using 17 microsatellite DNA loci. Overall, subdivision (Fst) was low (Fst = 0.031), but consistently higher between paired inlet and coast sites (mean Fst = 0.047) compared to among the five coast sites (Fst = -0.001) or among the five inlet sites (Fst = 0.026). Heterozygosity, allelic richness, and estimates of effective population size were also consistently lower in inlet sites, suggesting local inbreeding due to limited larval delivery from coastal habitats. Bayesian analysis of population structure identified two genetic groups across all samples, a single genetic group amongst only coast sites, two genetic groups amongst only inlet sites, and two genetic groups within each sound analysed separately. Copper rockfish collected from inlets were also consistently shorter, had lower condition factors, and grew more slowly than fish collected from coast sites. My results implicate inlet-coast seascape transitions in driving the evolution of population structure, likely resulting from inlet topography and estuarine circulation patterns that act to retain pelagic larvae within inlets and reduce physical connectivity with coastal habitats. Phenotypic differences between inlet and coast fish suggest differential growth environments across the inlet-coast seascape transition, which may promote genetic differentiation through selection against maladapted immigrant genotypes. Coast sites appear to be well served by the existing Rockfish Conservation Areas (RCAs), which have a coastally biased distribution. By contrast, inlet sites may require more specific local conservation measures as they appear to be less well connected to adjacent coast sites and may be more susceptible to overexploitation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,217
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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