Dataset and R code for Bottini et al. 2025_Effects of wintering under methylmercury exposure on spring reproductive onset in song sparrows (Melospiza melodia).
Notice bibliographique
Résumé
This folder contains all the datasets and R code needed to reproduce the analysis of manuscript from Bottini et al. 2025 "Effects of wintering under methylmercury exposure on spring reproductive onset in song sparrows (Melospiza melodia)" published in Journal of Neuroendocrinology (freely accessible on https://doi.org/10.1111/jne.70027). Project description: We assessed if MeHg exposure during winter may affect the bird's reproductive onset. The experiment main hypothesis and predictions were that due to MeHg exposure energetic cost / toxicity and the onset of seasonal change caused by photostimulation, the treatments (control vs MeHg) and time (almost 7 months of captivity) will affect the quantified physiological and neurological measures. Also, we predicted a potential time per treatment interaction, either caused by 1) bird's recovery from MeHg harm after a time without exposure, or 2) because the physiological changes associated with photostimulation promoted the appearance of latent MeHg effects not detected previously. Article Key Findings: • Winter exposure to methylmercury does not affect male song sparrows’ spring testes mass, syrinx mass, plasma androgen concentrations, overall number of GnRH neurosecretory cells, and body condition. • However, methylmercury exposure slightly decreased the development of cloacal protuberances after photostimulation and the number of region-specific GnRH producing cells. • Songbird male reproductive onset appears buffered against methylmercury’s deleterious effects but some carry-over effects on secondary sexual traits that may affect birds’ breeding performance.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».