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Enregistrement W6963001866 · doi:10.17632/kxg58xvygt.2

Phosphorylation as a candidate regulatory mechanism for effector recruitment to tankyrase

2025· dataset· en· W6963001866 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueMendeley Data · 2025
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphorylationEffectorAnkyrin repeatMechanism (biology)CancerPlasma protein bindingCancer cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unprocessed, original data for Broadway et al., 2025 Phosphorylation as a candidate regulatory mechanism for effector recruitment to tankyrase Benjamin J Broadway1,2 Katie Pollock1,2,4, Nora Cronin1,3, Robert Rottapel5,6,7, Frank Sicheri8,9, Sebastian Guettler1,2✉ 1Division of Structural Biology, The Institute of Cancer Research (ICR), London, UK. 2Division of Cancer Biology, The Institute of Cancer Research (ICR), London, UK. 3Present affiliation: The Francis Crick Institute, London, UK. 4Present affiliation: Cancer Research Horizons, CRUK Scotland Institute, Glasgow, UK. 5Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada. 6Departments of Medicine, Medical Biophysics and Immunology, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada. 7Division of Rheumatology, St. Michael's Hospital, Toronto, Ontario, Canada. 8The Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Mount Sinai Hospital, Toronto, Ontario, Canada. 9Departments of Molecular Genetics and Biochemistry, University of Toronto, Ontario, Canada. Summary: The TNKS and TNKS2 enzymes, collectively termed tankyrase, contribute to various cell functions, such as cell signalling, regulating glucose levels and maintaining chromosome ends. Tankyrase recruits its binding partners via a short peptide sequence called the tankyrase-binding motif (TBM), which binds to repeating portions of tankyrase known as ankyrin repeat clusters (ARCs). However, it is not yet clear if this binding event can be regulated. Our study suggests that adding a phosphate group to the eighth amino acid in the TBM, a reaction accomplished by protein kinases, can enhance the binding between tankyrase’s ARC domains and a subset of binding partners. By interrogating the human proteome, we find evidence that many binding partners can be phosphorylated at position eight in their TBMs. Overall, this suggests that phosphorylation of TBMs could be a way to specifically recruit binding partners to tankyrase, or stabilise their interaction with tankyrase, providing a novel means to control tankyrase function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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