iTrack Oysters September 2023 Experiment - Environmental and Oyster Health Data
Notice bibliographique
Résumé
This data package is a component of the Hakai Institute’s Marna Wet Lab and Caren Helbing (University of Victoria, UVic) collaborative iTrack project investigating environmental effects on eDNA and eRNA. Hakai Institute's Marna Wet Lab experimental research program uses laboratory experiments to evaluate marine organisms' responses to simulated current and future ocean environmental conditions. The overarching objective of Hakai Wet Lab experimental research is to investigate the mechanisms of vulnerability and resilience of a variety of marine species and communities under static or dynamic future environmental conditions, and understand how organisms are responding phenotypically, physiologically and/or genomically to thermal and acidification stress. This experiment was part two of a series of mesocosm experiments and took place at the Marna Wet Lab at Hakai’s Quadra Island Ecological Observatory September 19-28, 2023. The purpose of this experiment was to investigate eDNA and eRNA production and degradation of adult Pacific oysters (Crassostrea gigas) under different pCO2 and temperature conditions. Oysters were exposed to various temperatures (10oC and 20oC) and pCO2 concentrations (avg. 735 µatm and 1540 µatm), resulting in four distinct temperature/pCO2 treatments. One tank per temperature/pCO2 treatment combination contained no oysters to serve as a control. The oysters were destructively sampled for weight, size, ability to close valves, tissue condition, mantle recession, conchiolin deposits, lesions, digestive gland colouration, and gill and gonad DNA. This data package contains the mesocosm temperature and carbonate chemistry data and oyster health data only and will be available upon request until the manuscript has been accepted at which time the data will be made publicly available. In light of the effort required to obtain these data and create data packages, we request all data users that, in addition to following the CC-BY license terms, they give attribution to the data providers and follow fair use guidelines: 1) respect the data providers, and provide helpful feedback on data quality, and 2) communicate and/or collaborate with Hakai Marna Wet Lab researchers and collaborators if you are considering using this dataset for manuscripts or other forms of reporting.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,051 | 0,015 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».