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Enregistrement W6964186109 · doi:10.25394/pgs.26352976

Comparison of the Conservation Genetics of Blanding’s Turtles (Emydoidea blandingii) in the Eastern Great Lakes & Northeast Regions

2024· dissertation· en· W6964186109 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevuePurdue · 2024
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueTurtle Biology and Conservation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic diversityRange (aeronautics)PopulationConservation geneticsDisjunctMicrosatellitePopulation geneticsGenetic variationGenetic structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Blanding’s Turtle (<i>Emydoidea blandingii</i>) is a species of conservation needs that ranges across the U.S Midwest and Northeast, and Ontario/Nova Scotia, Canada. The species has experienced several range expansions and contractions due to glacial dynamics and industrial landscape changes, which have led to population isolation and bottlenecks. Understanding genetic variation and population structure across the species’ geographic range is essential for conservation efforts to maintain and restore populations. While several regional studies have evaluated genetic variation in <i>E. blandingii</i>, there has been little population sampling across Michigan and limited attempts to directly compare genetic variation across extensively sampled populations within both its main range and disjunct segments in the Northeast U.S. In this study, I utilized 12 microsatellite loci to directly compare the genetic diversity of <i>E. blandingii</i> across 153 localities in a portion of the Great Lakes and the Northeast of the range. Additionally, 13 microsatellite loci were used to assess genetic diversity across 92 localities in Indiana, Ohio, and Michigan, including further sampling within Michigan. My findings confirmed higher genetic diversity within the Great Lakes compared to the Northeast and revealed greater genetic differentiation in the Northeast than in the Great Lakes. Population structure in both regions was influenced by distance (IBD) and watersheds, with a more pronounced effect in the Northeast. Using four different genetic clustering approaches (PCA, sPCA, STRUCTURE, and TESS3r), I identified three range-wide clusters, three within the Northeast, and three within the Great Lakes. Within the Great Lakes, estimates of effective population size (<i>N</i>e) were high at both the population and watershed level, although influenced by sample size. The long lifespans of <i>E. blandingii</i> likely contribute to high levels of genetic diversity, while post-glacial gene flow across the landscape has resulted in low to moderate levels of differentiation within the regions. This study highlights poorly understood population structure and differences in genetic diversity between regions. Although Great Lakes populations are less isolated and more genetically diverse than those in the Northeast, this does not suggest that they are secure. Both regions face potential genetic loss over the next century, requiring further management implications to mitigate any further decline.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,952

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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