Evolutionary and acclimatory shifts in gene expression of Eurytemora affinis copepods reared in saline and freshwater conditions during laboratory experiments from 2011-2014
Notice bibliographique
Résumé
To explore mechanisms of freshwater adaptation and distinguish between adaptive (evolutionary) and acclimatory (plastic) responses to salinity change, we examined genome‐wide patterns of gene expression between ancestral saline and derived freshwater populations of the Eurytemora affinis species complex, reared under two different common‐garden conditions (0 vs. 15 PSU). These data include the RNA-seq Illumina short paired end reads (101 base pairs) of 10 freshwater and 12 saline copepods Eurytemora affinis samples. The freshwater copepod samples were collected in Lake Michigan (Racine Harbor), while the saline copepods were collected in Baie de L'Isle Verte, St. Lawrence marsh, Quebec, Canada. These data have important implications for our understanding of the evolutionary and physiological mechanisms of range expansions by some of the most widespread invaders in aquatic habitats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,017 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,008 | 0,007 |
| Communication savante | 0,005 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,025 | 0,077 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».