Exposure-, infection, and vaccine-induced immune responses to SARS-COV-2
Notice bibliographique
Résumé
There is tremendous diversity in the way individuals experience severe acute respiratory coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection. We analyzed immune responses to SARS-CoV-2 in the context of susceptibility to infection before and after vaccination. Within a cohort of subjects who were highly exposed to SARS-CoV-2 prior to vaccination and seronegative against the immunodominant spike (S) protein, there was evidence of cross-reactive immunoglobulin (Ig) G to nucleocapsid (N) from common -coronavirus exposure and specific cellular immune responses against SARS-CoV-2 envelope (E), membrane (Mem), N, and S proteins. There was no evidence of underlying innate protection or natural immunity against SARS-CoV-2. Considering that the strength of the cellular immune responses correlated with time since exposure, we speculated that either rapid cellular immune responses or abortive infection resulted in infection being contained below the threshold for direct viral detection or generation of a humoral immune response. We analyzed the characteristics and significance of circulating vaccine-induced IgA in a post-vaccination cohort with a relatively high incidence of breakthrough infection. Higher levels of vaccine-induced IgA were negatively associated with breakthrough infection. Breakthrough Omicron infection increased anti-ancestral S IgA responses more than booster vaccines. Longitudinal analysis of post-infection anti-S IgA decay showcased the durability of infection-induced responses. As reported for IgG responses, vaccination with ancestral SARS-CoV-2 S antigen-imposed imprinting on circulating IgA responses. This research addressees the variability in humoral and cellular immune responses to SARS-CoV-2 and illustrates how the timing and nature of exposure to viral antigens impact the responses generated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».