Notice bibliographique
Résumé
This release contains a number of breaking, fixing, and useful changes. We encourage users to review our heavily expanded documentation at tedana.readthedocs.io Bug Fixes: PCA has been overhauled to a new and more reliable method, averting a known bug where too many PCA components would be selected. Environments are not coerced to single-threaded computation after calling tedana. Fixed variance-explained outlier detection problem where first value was always NaN and variance explained was always negative. Fixed component table loading bug that resulted from unexpected pandas behavior. Fixed bug where the wrong number of echoes would be allocated in-program. Fixed bug where only selecting one component would cause an error. Correctly incorporate user-supplied masks in T2* workflow. Fixed bug in PAID combination where mean of data would be used instead of SNR. Breaking Changes: Log files are now by datetime, allowing multiple runs to have systematic naming. Filenames for decomposition and metric maps are now BIDS derivative-compatible. Please see documentation for the full list of new filenames. Component tables are now in .json format Changed tab-separated files from .txt to .tsv file extension. Removed the --sourceTEs option. T2* maps are now in seconds rather than milliseconds. --mle option is now deprecated. Changes in Defaults: New PCA algorithm is default, please see documentation for more information. Clustering is now bi-sided rather than two sided (positive and negative clusters are now grouped separately). Static png images are now the default; use --nopng to avoid this. Files are now gzipped by default. New Features: Massively expanded documentation, please see tedana.readthedocs.io to view the updated usage help, multi-echo background, developer guidelines, and API documentation. New PCA decomposition algorithm (default). Adds the --out_dir argument to t2smap workflow to choose what directory files are written to. t2smap workflow is now fmriprep compatible Added --t2smap argument to allow you to supply a precalculated T2* map. Thanks to Logan Dowdle, Elizabeth DuPre, Cesar Caballero Gaudes, Dan Handwerker, Ross Markello, Isla, Joshua Teves, Eneko Urunuela, Kirstie Whitaker, and to the NIH Section on Functional Imaging Methods for supporting the tedana hackathon and the NIH for supporting the AFNI Code Convergence, where much of the work in this release was done.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,005 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,006 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,011 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,008 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,546 | 0,540 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».