MouseBytes: an open-access and web-based repository for cognitive data integration and sharing
Notice bibliographique
Résumé
Neuroscience is undergoing an open-access revolution. Repositories in areas such as neuroimaging and genomics have provided a paradigm shift in the way we are now able to analyze, share, and re-use vast amounts of data from multiple laboratories. Unfortunately, one area that is far behind in this respect is behavioural evaluation of animal models. Thanks to a new set of automated tests based on touchscreen technology [1], there is potential for standardized outputs in animal behavioral neuroscience that are consistent with open-access sharing. However, there is currently no mechanism to provide quality control for such data or to deposit them in an open access repository for reuse, like approaches used in the imaging and genomics fields. In order to enable cognitive data, obtained using the highly translatable and automated touchscreen technology to join the open-access revolution, we have developed MouseBytes, a web-based repository that enables researchers to store, share, visualize, and analyze cognitive data. We envision that MouseBytes will be the premier platform to allow cognitive data to become open access, searchable and to be reused. Furthermore, MouseBytes will support the innovative integration of standardized behavioural with MRI and RNA-sequencing, allowing comprehensive multi-modal information in mouse models of disease.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,012 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,007 | 0,012 |
| Science ouverte | 0,008 | 0,014 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,028 | 0,029 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».