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Enregistrement W6968817658 · doi:10.5281/zenodo.3819420

The biology and epidemiology of 'Candidatus Liberibacter solanacearum' and potato phytoplasmas and their contribution to risk management in potato and other crops (PhyLib II)

2020· article· en· W6968817658 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytoplasmas and Hemiptera pathogens
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetagenomicsEpidemiologyDisease managementDNA sequencingGenetic diversityCroppingCropMediterranean climateGenomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PhyLib II is a consortium of 18 institutions from 14 countries that continued the work of the PhyLib consortium. The consortium collaborated on the project: ‘The biology and epidemiology of ‘<em>Candidatus </em>Liberibacter solanacearum<em>’ (Lso)</em> and potato phytoplasmas and their contribution to risk management in potato and other crops (PhyLib II)’. The aims of this project were to expand knowledge of emerging bacterial plant diseases associated with the presence of phytoplasmas and Lso and to survey their distribution, genetic diversity, epidemiology, insect vectors, and risk to crops worldwide. The consortium aimed to co-ordinate research on these crop pests and to provide a network of expertise to develop detection methods and a framework within which to share knowledge and compare the experiences of disease epidemiology across a wide range of geographical locations including North America (Canada), Northern Europe, the Mediterranean basin, Central Europe and Eastern Europe. The consortium developed and validated methods for the extraction of metagenomic DNA and total RNA and for the detection of bacterial DNA from complex matrices including plants, seeds and insect vectors. This involved testing current methodologies and developing novel approaches including High Throughput Sequencing (HTS)-based diagnostic techniques. Through field surveys carried out by the partners, our knowledge of the distribution and genetic diversity of phytoplasmas and Lso worldwide has improved. This includes the discovery of novel Lso haplotypes in different plants and insect vectors and the finding of Lso and phytoplasmas in areas where hitherto they were not known to be present. The consortium was effective in promoting exchange of materials between partners and sharing knowledge, enabling countries to facilitate testing for phytoplasmas and Lso. The consortium will build on the success of PhyLib II and the Euphresco project PhyLib III (17 institutes from 14 countries) has started in 2020.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,782
Score d'incertitude au seuil0,743

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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