A simple one-dimensional NPZD model with graphical user interface
Notice bibliographique
Résumé
This github code is a simple, 1-dimensional NPZD model in Matlab, based on Kuhn et al. (2015, doi.org/10.1016/j.pocean.2015.07.004), with a Graphical User Interface (GUI). The model is representative of a location at 50 degree N in the North Atlantic Ocean and the mixed layer evolution from this location is imposed. The model is run for 2 years, but only the 2nd year is shown in the auto-generated plots. The satellite-observed surface phytoplankton evolution at this location is shown for comparison in the surface property plot. The GUI is called from the Matlab command line as follows: >> GUI_NPZD A window will pop up that allows the user to modify 4 parameters: the latitude of solar forcing, the initial nutrient concentration, the maximum phytoplankton growth rate, and the maximum zooplankton grazing rate. These parameters can be adjusted by using the sliders or typing new values directly into the corresponding editbox. If the value entered is outside the allowable range indicated by the slider, it will be reset to the corresponding allowable maximum or minimum. The buttons below the four sliders allow the user to run the model or quit the GUI. The evolution of state variables at the surface layer will be written into a Matlab file along with essential meta-information. The code is also used in the article "Ocean Biogeochemical Modelling" in Nature Review Methods Primers by Fennel et al. (2022).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,039 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».