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Enregistrement W6969240178 · doi:10.5683/sp2/e8ykxw

Molecular mechanisms underpinning buoyancy control in the aquatic larvae of Chaoborus evolved from tracheal fluid clearing functionality

2025· dataset· en· W6969240178 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueBorealis · 2025
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLarvaBuoyancyMidgeRespiratory systemBurrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aquatic larvae belonging to the midge genus Chaoborus are the only truly pelagic insects, possessing the ability to regulate their buoyancy and position in the water column. They achieve this buoyancy control using two pairs of closed, air-filled sacs which are derived from the longitudinal trunks of their tracheal system. Previous work has revealed that the volume of these air-sacs is controlled using a unique mechanochemical system, where bands of the protein resilin alternate with bands of tracheal cuticle in the air-sac wall to produce a composite material which expands and contracts when exposed to changes in pH. While a simple epithelium enveloping each air-sac is known to control the pH of the resilin bands, the molecular mechanisms underpinning its ability to regulate pH, and thus control the air-sac’s volume, are unknown. To reveal these mechanisms, and how this functionality evolved, we compare the transcriptomes of air-sacs from Chaoborus trivitattus larvae with tracheal tissue from the aquatic larvae of two other genera within the Chaoboridae: Eucorethra underwoodi whose larvae possess an unmodified tracheal system which they use to breathe air using a posterior respiratory siphon, and Mochlonyx cinctipes whose larvae possess a tracheal system with dilated anterior and posterior sac-like regions, but which remains open through a posterior siphon. We found that Chaoborus air-sac epithelia show strong expression of ion channels related to pH regulation relative to Eucorethra tracheal tissue, including orthologs of NHA1, Nhe2, Ae2, and pHCl-2, as well as high levels of transcript abundance of the aquaporin water channel, Drip. This suggests that the tracheal epithelium of the ancestral chaoborid possesses all the functionality required to control pH and deal with the flux of water associated with the swelling and contraction of the resilin as part of the ancestral liquid-clearing function of the tracheal epithelium, setting the stage for the evolution of a novel buoyancy control mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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