Costs of in-house genomic profiling and implications for economic evaluation: a case example of non-small cell lung cancer (NSCLC)
Notice bibliographique
Résumé
Genomic profiling in oncology is vital for determining eligible patients for mutation-specific targeted therapies. Use of commercial genomic testing has the potential to improve patient outcomes. Economic evaluations of in-house genomic profiling typically only include material costs while external commercial services include many other factors. Using non-small cell lung cancer (NSCLC) as an example, this study sought to characterize the unique challenges of costing testing services and their impact on results of economic evaluations. Structured interviews with Canadian oncologists, pathologists, and laboratory directors were conducted to identify material and non-material costs associated with genomic-testing laboratories to allow estimation of a more complete cost of in-house testing, with NSCLC cost-per-test calculated using annual operational costs and NSCLC-specific testing volume. A health and budget impact model of in-house versus external commercial profiling services was used to compare the impact of non-material costs on results. In-house testing costs, limited to materials, was $133/single-gene test and $1,400/panel. For a laboratory running 1,300 in-house tests/year, total annual non-material costs included equipment maintenance ($6,842), labor ($502,313; technicians, administrative, and medical staff), shipping/reporting and software updates ($146,050), for an additional $519/test. The combined cost of $652/single-gene and $1,919/panel was compared to a cost of $6,194 for a commercial external test. Based on current Canadian testing patterns and anticipated utilization of external testing, inclusion of in-house non-material costs reduced the estimated 3-year budget impact by 12%. When conducting economic evaluation to assess the value of introducing external tests, it is critical that non-material costs of standard testing strategies be measured and incorporated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,019 | 0,049 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,006 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».