Bioactive potential of a new strain of Streptomyces sp. PP14 isolated from Canadian soil
Notice bibliographique
Résumé
A new actinomycete strain designated PP14 was isolated from a Canadian soil sample, by a dilution agar plating method using a chitin-vitamins B medium supplemented with different antibiotics as selective agents. This actinomycete produced antimicrobial substances and exhibited strong antifungal activity against mycotoxigenic fungi includingAspergillus carbonarius (M333) and Penicillium expansum, and also against phytopathogenic fungi such as Fusarium oxysporum f. sp. lini (Foln 3-5) and F. culmorum. In addition, the strain showed strong activity against the yeast Saccharomyces cerevisiae (ATCC 4226). On the other hand, the strain exhibited an interesting antibacterial activity against bacteria including multi-resistant Klebsiella pneumoniae(E40). The highest antimicrobial activities were obtained on ISP2 medium. The n-butanol extract contained three bioactive spots detected on thin layer chromatography (TLC) plates. Strain PP14 was identified by morphological, chemotaxonomic and phylogenetic analyses to the genus Streptomyces. The 16S rRNA gene sequence similarities showed that strain PP14 is closely associated with members of the Streptomyces violaceoruberspecies group (S. violaceoruber, Streptomyces violaceolatus, Streptomyces tricolor,Streptomyces humiferus, Streptomyces coelescens and Streptomyces anthocyanicus). Furthermore, the comparison of physiological characteristics of strain PP14 with the S. violaceoruber species group showed significant differences. Our results showed that strain PP14 represents a distinct phyletic line suggesting a new genomic species. Key words: Actinomycetes, Streptomyces, antimicrobial compounds, extremophile microorganisms, multi-resistant bacteria, Canadian soil.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».