Additional file 5 of Channel nuclear pore protein 54 directs sexual differentiation and neuronal wiring of female reproductive behaviors in Drosophila
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 5 NUP54 is highly conserved, but variation in the FG repeat region is not the cause of an altered post-mating response. A) Sequence alignment of NUP54 from closely related species. Amino acids deviating from D. melanogaster are indicated in black. Intron positions are indicated by black arrowheads and the stop codon of the Nup54MB03363 allele is indicated by a red arrow head. Green and white filled arrowheads indicate maintained (>1%) and rare (<1%) polymorphisms with amino acid changes indicated on top. The line below the sequence indicates the NgoMIV-BamHI fragment that was replaced in the gNup54elegans construct. Nucleotides 1-115 according to human NUP54 impasse the FG region, nucleotides 116-346 the α/β region and nucleotides 346-494 the α-helical region. The amino acids in exon 3 have been shown to bind to NUP62 and the amino acids in exon 5 bind to NUP58. B) Receptivity of wild type, gNup54 and gNup54elegans females homozygous for Df(2R)9B4 after sex-peptide (SP) or Ringer’s (R) injection measured by counting mating females in a 1 hr time period 3 hr after SP or R injection, respectively. Means with the standard error for three experiments with 8-15 females each are shown, and statistically significant differences from ANOVA post-hoc pairwise comparisons are indicated by different letters (p≤0.001). C) Oviposition of gNup54 and gNup54elegans females homozygous for Df(2R)9B4 after sex-peptide (SP) or Ringer’s (R) injection shown as means of eggs laid in 18 h with the standard error for 10 females each, respectively. Statistically significant differences from ANOVA post-hoc pairwise comparisons are indicated by different letters (p≤0.001). The data underlying the presented graphs are in Additional file 6.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,867 | 0,184 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».