Metadata record for the article: Evaluation of multiple transcriptomic gene risk signatures in male breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
Summary This metadata record provides details of the data supporting the claims of the related article: “Evaluation of multiple transcriptomic gene risk signatures in male breast cancer”. The related study presents the gene expression results of 381 M0, ER+ve, HER2-ve male male breast cancer (BCa) patients enrolled in the Part 1 (retrospective analysis) of the International Male Breast Cancer Program, as described in https://doi.org/10.1093/annonc/mdx651. Type of data: survival analysis Subject of data: Homo sapiens Sample size: 381 Population characteristics: EORTC/TBCRC/BIG/NABCG International Male Breast Cancer Program enrolled male patients with histologically proven BCa, diagnosed between 1990 and 2010, across multiple participating institutions. Data access The data underlying the Kaplan Meier survival curves and tables that support the findings of this study are available from European Organisation for the Research and Treatment of Cancer (EORTC). However, the data are not publicly available and restrictions apply to their availability as they were used under license from EORTC for the current study. Data can be made available with the permission of EORTC. Data enquiries can be made to the corresponding author, and data requests can be made at https://www.eortc.org/data-sharing/. Corresponding author(s) for this study John M. S. Bartlett. Ontario Institute for Cancer Research, Diagnostic Development, MaRS Centre, 661 University Avenue, Suite 510, Toronto, ON M5G 0A3, Canada. 647-259-4251. John.Bartlett@oicr.on.ca Study approval Ethics approval was provided by the University of Toronto (#30035).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,041 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,011 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,585 | 0,233 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».