Additional file 1 of Geo-epidemiology of autoantibodies in rheumatoid arthritis: comparison between four ethnically diverse populations
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Supplementary Figure 1. AMPA and control peptide reactivity in RA and HCs. Levels in arbitrary units (aU/mL) for four AMPAs in the serum of four ethnically diverse RA populations and their ethnicity-matched healthy controls (HC). Grey dots indicate reactivity to the control peptide that was tested in tandem with the AMPA (which are shown with black dots). Blue violin plots display the median, interquartile range, and distribution of levels.NL: Netherlands, FN: First Nation, JP: Japan, SA: South Africa, RA: RA patients, HC: healthy controls. Supplementary Figure 2. Autoantibody levels in patients seropositive for each AMPAs in ethnically diverse RA populations. Levels in arbitrary units (aU/mL) for four AMPAs in the serum of four ethnically diverse RA populations. Patients clustered at the maximum were above the highest standard of the ELISA. Grey shading indicates the cohort-specific cut-off (see Supplementary Figure 2 for data regarding cut-off determination in healthy controls and reactivity to the control peptide). Lines indicate median and interquartile range and p-values correspond to Mann-Whitney U tests. Supplementary Figure 3. Autoantibody levels in patients seropositive for each AMPAs in ethnically diverse RA populations. Ratios of levels in arbitrary units (aU/mL) for four AMPAs per grams per liter (g/L) total IgG in the serum of four RA populations. Ratios are only shown in patients that were positive for the AMPA and that were also not above the highest standard. Lines indicate median and interquartile range; p-values correspond to Mann-Whitney U tests. The range of aU/mL per g/L are not directly comparable between AMPAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,032 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,818 | 0,102 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».